转录组(英語：Transcriptome)，也称为“转录物组”，广义上指在相同环境（或生理条件）下的在一个细胞、或一群细胞中所能转录出的所有RNA的总和，包括信使RNA（mRNA）、核糖体RNA（rRNA）、转运RNA（tRNA）及非编码RNA；狭义上则指细胞所能转录出的所有信使RNA（mRNA）。...

转录（英語：Transcription）是在RNA聚合酶的催化下，遗传信息由DNA复制到RNA（尤其是mRNA）的过程。作为蛋白质生物合成的第一步，转录是合成mRNA以及非編碼RNA（tRNA、rRNA等）的途径。 真核生物合成蛋白质的转录过程以特定的单链DNA片段作为模板，RNA聚合酶作为催化剂，...

它将不同的组学技术例如转录组学（transcriptomics）和蛋白质组学（proteomics）与饱和突变体集合相结合。 基因组学 ：研究生物体的基因组。 认知基因组学（英语：Cognitive genomics）: 研究与遗传特征相关的认知过程的变化。 比较基因组学: 研究不同生物物种或菌株之间基因组结构和功能的关系。...

组上已经推定出大约1800个基因控制转录因子的编码。 转录因子具有DNA序列的识别、结合以及控制基因表达的基本机能。在基因转录活性化以及相反地去活性化，以及细胞内很多反应中扮演重要的角色。除此之外以下列出一些重要的机能以供参考。 基本性的转录调节 在真核生物中，转录开始时基本转录...

反转录转座子（Retrotransposon），又譯逆轉錄轉位子，是由RNA介导转座的转座子的元件，在结构和复制上与反转录病毒（retrovirus）类似，只是没有病毒感染必需的env基因。它通过转录合成mRNA，再逆转录合成新的元件整合到基因组中完成转座，每转座1次拷贝数就会增加1份，可以增強自己...

转录后修饰（RNA修飾，或稱修飾RNA）是真核细胞中，将初级转录RNA转化为成熟RNA的加工过程。一个很好的例子就是前mRNA转化为成熟的mRNA，其中包括剪接，并发生在蛋白质生物合成之前。这一加工过程对于真核生物基因组的正确翻译至关重要，这是因为真核生物的初级转录RNA中包含既包括用于编码蛋白质的外显子又包含非编码的內含子。...

转录发生在细胞核内，核中的DNA一般被包装成核小体以及更高级的染色质结构。真核生物基因组的复杂性决定了基因表达控制的多样性和复杂性。 转录是将存储在DNA链中的遗传信息复制到mRNA互补链（英语：Complementarity (molecular biology)）中的过程。 真核转录...

cerevisiae）中的一种转录因子，是酵母基因组中的“主调节因子”（"master regulator"），调节接近十分之一的酵母基因组。 在Razaghi等人的一项研究中，氨基酸饥饿实验激活了转录因子Gcn4，导致几乎所有参与氨基酸生物合成的基因都被诱导转录，包括组氨醇脱氢酶基因 HIS4和Γ-干扰素基因...

转录物组散彈枪法测序 Whole Transcriptome Shotgun Sequencing，简称WTSS）是基于第二代测序技术的转录组学研究方法。RNA测序是使用第二代测序的能力，在给定时刻从一个基因组中，揭示RNA的存在和数量的一个快照的技术。 首先提取生物样品的全部转录...

已经通过基于质谱法的蛋白质组分析发现了癌症的生物标志物(Biomarker)。 蛋白质组学的使用或蛋白质组的研究是个性化医学(personalized medicine)的一大进步，可以根据患者特定的蛋白质组学和基因组特征定制药物混合物。 蛋白質组的体量大於基因组，这种差距在真核生物中表现得更为明显。因为很多mRNA在转录完成以后，会经历RNA剪接（RNA...

在基因组学和转录组学之后，蛋白质组学是在生物系统研究的下一个步骤。它是比基因组更为复杂，因为生物的基因组或多或少还是恒定的，但是蛋白质是细胞和细胞各不相同，并且在时间上各不相同。在不同的细胞类型中独特的基因被表达，这意味着在细胞中所产生的即使是基本的蛋白质组也需要被鉴定。...

目（英语：Ortervirales）的病毒），但相較於反轉錄病毒可形成病毒顆粒離開細胞，LTR反轉錄轉座子僅能在原本的細胞中複製增殖。LTR反轉錄轉座子在植物基因組中占比很高，如小麥基因組有高達75%的序列為LTR反轉錄轉座子。 LTR反轉錄轉座子可依序列分為Ty1-copia類、Ty3-gyps...

组学分析揭示了细胞中产生的一组基因产物，这些数据代表了细胞功能的一个方面。 相反，代谢分析可以提供该细胞生理学的即时快照， 因此，代谢组学提供了生物体的直接“生理状态的功能读数”。 代谢物组和其他细胞整体（基因组、转录组、蛋白质组、和脂类组...

组水平的变异，同时还会关注表观遗传水平上的甲基化和组蛋白修饰变化，转录组上的基因表达差异或者蛋白组上的肿瘤细胞的蛋白浓度和功能情况。总之，肿瘤基因组学专注在研究肿瘤细胞在基因组，表观组和转录组水平的变化。 随着20世纪90年代很多组织DNA序列的测定，基因组学逐渐建立起来。到了21世纪，人类基因组...

组哪些区域中的一种计算方法。当免疫沉淀的蛋白质是一种转录因子时，那么DNA的富集区域就是这种它的转录因子结合位点（TFBS）。主流的Peak calling软件有MACS等。 Peak calling可应用于转录组/外显组测序，亦可用于对MeRIP-测序或m6A-测序的RNA表观基因组...

国际癌症基因组联盟（英語：International Cancer Genome Consortium，缩写ICGC）是一个国际间合作的组织，成立于2008年，为全世界的癌症基因组研究人员提供一个合作论坛，来协调全球50种癌症类型或亚型的大规模癌症基因组研究。其目标为在基因组水平、表观基因组水平和转录组...

前病毒在宿主细胞RNA聚合酶的作用下，从反链DNA转录合成出新的正链RNA基因组。 正链RNA基因组部分被加工为mRNA，翻译出结构蛋白。 结构蛋白与正链RNA基因组组装成为新的病毒。 反轉錄病毒科（Retroviridae）可分为二类： 正反轉錄病毒亞科（Orthoretrovirinae） α反轉錄病毒屬（Alpharetrovirus）...

hybridization）这项技术可使对照组（驱赶子）与试验转录物组cDNA片段中仅不相同的部分得到PCR扩增。转录物相对丰度的差异就被突出显示，例如不同物种间的遗传学差异。此项技术基于：对照品与试样间杂交而形成的双链DNA（dsDNA）被移除，因此消除了cDNA或gDNA中丰度相似的部分，仅剩下差异表达或序列、转录物或基因组序列有变异的部分。...

组），完整的蛋白质集合（蛋白质组）和完整的转录物集合（转录物组）。关于代谢物组的第一本书于2003年出版。第一本致力于代谢物组学的杂志（简称《代谢物组学》）于2005年推出，目前由Royston Goodacre博士主编。 关于代谢组学分析的一些更重要的早期论文列在下面的参考文献中。 代谢物组...

组蛋白乙酰化和脱乙酰化及RNA干扰相关）因素。職司不同功能的細胞或不同的细胞类型中，活化而表現的基因也不同。在某一细胞类型当中所有被表达的基因叫转录组，所有编码蛋白质的基因叫蛋白质组。通过即时聚合酶链式反应或染色质免疫沉淀-测序可得到转录组及蛋白质组的信息。用电脑处理基因序列的学科叫生物信息学。...

信号转导及转录激活蛋白（英語：Signal Transducer and Activator of Transcription或英語：Signal Transduction And transcription，简称为STAT蛋白）在细胞的存活、生长和分化等许多方面起调节作用的转录因子家族，并由JAK激酶激活。...

sbRNA（stem-bulgeRNA）是一个非编码RNA家族，最早在秀麗隱桿線蟲（Caenorhabditis elegans）的全转录组cDNA筛选中发现，随后的实验证明其保守的5'端和3'端会根据碱基互补配对形成“茎”（stem），剩余部分形成一个“膨大”（bulge）。 Deng W, Zhu...

δ-反轉錄病毒屬 (Deltaretrovirus)是一個反轉錄病毒科的屬。它外源幾組在哺乳動物身上發現。 例子有牛白血病病毒和人類T型淋巴細胞白血病病毒。 微生物免疫學-Retroviridae(反轉錄病毒科) （页面存档备份，存于互联网档案馆）...

E2F是一组编码高等真核生物转录因子家族的基因。其中三个是激活剂：E2F1,E2F2和E2F3a。其他六个充当抑制剂：E2F3b,E2F4,E2F5,E2F6,E2F7a,E2F7b和E2F8。它们都参与哺乳动物细胞中DNA的细胞周期调控和合成。E2F作为转录因子与目标启动子序列中的...

轉錄。調控基因未必是操縱子的一部份，但是位於基因組的某一處。阻遏基因會到達操縱基因阻礙結構基因的轉錄。 原核生物的一个转录区段可视为一个转录单位，也称作操纵子。 一個啟動子是一組DNA序列能使一個基因進行轉錄。啟動子是由RNA聚合酶所確認，並且引發轉錄。在RNA的合成中，啟動子是一種方法區分哪一個基...

Klug）实验室的爪蟾非洲爪蟾（Xenopus laevis）的转录研究中发现。对特定RNA序列转录的研究表明，小转录因子（转录因子IIIA; TFIIIA）的结合强度是由于存在锌配位的手指状结构。TFIIIA的氨基酸测序揭示了9个30个氨基酸的串联序列，包括两个不变对的半胱氨酸和组氨酸残基。扩展的X射线吸收精细结构（英语：Extended...

顺反组（英語：cistrome）指的是“全基因组尺度下反式作用因子的顺式作用靶点的集合，也可以说是在体情况下转录因子结合位点或组蛋白修饰在全基因组上的位置”。“顺反组”这一术语是cistron（顺反子）和genome（基因组）的混成詞，最初由达纳-法伯癌症研究所和哈佛医学院的研究者命名。...

轉錄激活因子(英文：Activator)是一種蛋白質轉錄因子，可增加一個基因或一組基因的轉錄。轉錄激活因子被認為對基因表達具有積極的調控作用，因為它們具有促進基因轉錄的功能，在某些情況下是基因轉錄所必需的。大多數激活因子是與增強子和啟動子近端元件結合的DNA結合蛋白。與激活因子結合的DNA位點稱為“...

瓦片阵列与传统微阵列之间的不同之处在于探针的性质：瓦片阵列的探针并不是对散列在整个基因组中的已知或预测基因的序列进行探测，而是对连续区域内存在的已知序列进行密集地探测。这有助于表征已测序但功能却知之甚少的区域。瓦片阵列可用于：辅助转录物组作图、发现DNA/蛋白质相互作用（ChIP-chip和DamID）位点、D...

转录物（Perkel 2013）。该有些武断的界定将长链非编码核糖核酸与较小的调控核糖核酸区分开来，后者如微核糖核酸（miRNAs）、小干扰核糖核酸（siRNAs）、Piwi互作核糖核酸类（piRNAs）、小核仁核糖核酸（snoRNAs）及其它短核糖核酸（Ma 2013）。 近年研究显示人类基因组...

欧洲生物信息研究所为科学界提供免费生物信息资源、促进基础研究、提供培训和传播行业尖端技术。欧洲生物信息研究所管理和维护着多个大型生物信息公共数据库， 跨基因组学，蛋白质组学，化学信息学，转录组学，系统生物学等，同时创建了多种工具供让研究人员分析和分享信息。欧洲生物信息研究所提供最优质的研究环境、无数跨学科的合作机会以及遍及世界各地的培训课程。...