タンパク質ドメイン（Protein domains）は、タンパク質の配列、構造の一部で他の部分とは独立に進化し、機能を持った存在である。それぞれのドメインはコンパクトな三次元構造を作り、独立に折り畳まれ、安定化されることが多い。多くのタンパク質がいくつかのドメインより成り立ち、1つのドメイン...

タンパク質（タンパクしつ、蛋白質、英: protein [ˈproʊtiːn]、独: Protein [proteˈiːn/protain]）とはアミノ酸が鎖状に多数連結（重合）してできた高分子化合物。生物の重要な構成成分のひとつである。 構成するアミノ酸の数や種類、また結合の順序によって種類が異な...

ドメイン系（英語版）の分類体系で導入された概念である。 3ドメイン系による生命樹は、古細菌（Archaea）・細菌（Bacteria）・真核生物（Eukarya）の3つのドメインで構成される。2ドメイン系（英語版）においては、古細菌と細菌の2つのドメイン...

SH2ドメイン（Src homology 2 domain）はおよそ100アミノ酸残基からなるタンパク質ドメインの1つで、がん遺伝子由来のタンパク質SrcとFpsの共通配列として発見された。 同様の構造を持つタンパク質は後にシグナル伝達に関わるタンパク質など、細胞間タンパク質より多数発見された。...

多くのタンパク質はいくつかのユニットから成り立っている。タンパク質ドメインはタンパク質全体の構造の要素の1つであり、それ自体で安定化され、他の部分とは独立にフォールディングもなされる。多くのドメインは1つの遺伝子や遺伝子ファミリーによって作られるタンパク質に特有のものではなく、多くの種類のタンパク質...

Gタンパク質（Gタンパクしつ）は、グアニンヌクレオチド結合タンパク質（グアニンヌクレオチドけつごうタンパクしつ）の略称であり、GTPまたはGDPを結合して活性のON/OFFを行うことにより、細胞内情報伝達に関与する。このうち、Rasに代表される低分子量GTPアーゼ（分子量は20から30kDaほど　単...

タンパク質ファミリーにほぼ対応する（タンパク質をコードしないncRNA遺伝子を除く）。 具体的には、一次構造の相同性が統計学的に有意に高いものを、共通祖先タンパク質に由来すると想定し、タンパク質ファミリーを設定している。タンパク質分子を構成する構造上の単位には、立体的および機能的単位であるドメイン...

ドメインのマッピングに基づいて、タンパク質内およびタンパク質間のドメイン-ドメイン相互作用をカタログ化するiPfamなどの他のリソースの作成にも使用されている。 Pfam内の各ファミリーについて、次のことができる。 ファミリーの説明を表示する マルチプルアラインメントを表示する タンパク質ドメインの構造を表示する...

Gタンパク質共役受容体（ジータンパクしつきょうやくじゅようたい、英: G protein-coupled receptor、GPCR）は、生体に存在する受容体の形式の1つである。様々な機能を持ったGタンパク質共役受容体が見られ、既知のタンパク質の中では最大のスーパーファミリーを形成している。別名と...

ドメインと細胞内ドメインを形成している。大きなペプチドリガンドの結合部位は、通常、細胞外ドメインに位置し、小さな非ペプチドリガンドの結合部位は、7つのαヘリックスと1つの細胞外ループの間に位置することが多い。前述の受容体は、Ｇタンパク質を介して異なる細胞内効果器系と結合される。Gタンパク質...

プロテインキナーゼ (Protein kinase; プロテインカイネース) は、タンパク質分子にリン酸基を付加する（リン酸化する）酵素である。タンパク質キナーゼあるいは英語風にプロテインカイネースとも呼ぶ。キナーゼ（リン酸基転移酵素）の中でタンパク質をリン酸化するキナーゼをプロテイン...

ドメインタンパクは他の転写因子また、しばしばホメオドメインタンパク質との複合体としてその標的遺伝子のプロモーター領域で働いている。そのような複合体は単独のホメオドメインタンパク質よりも高度な標的特異性を持つ。 ホメオドメインを含むタンパク質...

ドメインで小胞体内腔に標的化され、タイプIIIはそのN末端ドメインで小胞体内腔に標的化される。タイプIVは、そのN末端ドメインが細胞質に標的化されるIV-Aと、N末端ドメインがER内腔に標的化されるIV-Bに細分化されている。4つのタイプでの区分の意味合いは、タンパク質...

ホメオドメインフォールド（Homeodomain fold）はタンパク質ドメインの1つで、DNA、RNAに結合し、特に転写因子によく見られる。60アミノ酸残基のヘリックスターンヘリックスからなり、3つのαヘリックスが短いループ領域でつながれている。N末端側の2つのヘリックスは逆平行に並び、C末端側...

タンパク質の疎水性コア、2つのタンパク質ドメイン間の界面、またはオリゴマータンパク質のサブユニット間の界面に、完全または部分的に埋もれていることがよくある。この無極性環境では、これらの残基は高い量子収率を持ち、それゆえ高い蛍光強度を示す。タンパク質...

DNA結合ドメインは、多くの場合、異なる機能を備えた別のタンパク質ドメインと共に大きなタンパク質を構成する。この他のドメインは、しばしばDNA結合ドメインの活性を調節する。DNA結合ドメインの機能は構造の形成、もしくは転写制御への関与、あるいはこの両方である。 DNA構造に関与するDNA結合ドメイン...

ジンクフィンガー（Zinc finger）はタンパク質ドメインの大きなスーパーファミリーの1つで、DNAに結合する性質を持つ。ジンクフィンガーは2つの逆平行βシートと1つのαヘリックスからなる。小さすぎて疎水中心を持たないため亜鉛イオンが安定化にとって重要である。...

状態で構造を巻き付けながら、その酵素の中で構造変化を誘導する。 「認識ドメイン」経由で重要なタンパク質間相互作用 細胞質の構成要素である細胞膜に固定されたNADPHオキシダーゼのリン酸化。現在のマルチタンパク質酵素は、食細胞の作用のタンパク質間相互作用の調節で重要な酵素の役割を果たしている。 タンパク質分解の重要性...

タンパク質に関する情報も提供します。NCBIの構造データベースには、NCBIによってインポートされた、PDBで実験的に決定された構造の3D座標セットが含まれている。タンパク質の保存ドメインに関するデータベース（CDD）には、タンパク質配列内の高度に保存されたドメイン...

Rosettaをはじめとするほとんどの三次構造モデリング手法は、単一のタンパク質ドメインの三次構造をモデリングするために最適化されている。タンパク質を潜在的な構造ドメインに分割するために、通常、ドメイン解析またはドメイン境界予測と呼ばれるステップが最初に行われる。三次構造予測の他の部分と同様に...

タンパク質複合体(英語: protein complex)または多タンパク質複合体(英語: multiprotein complex)は、2つ以上の関連するポリペプチド鎖のグループである。異なるポリペプチド鎖は、異なる機能を持っている場合がある。これは、単一のポリペプチド鎖に複数の触媒ドメイン...

ウィクショナリーに関連の辞書項目があります。 ドメイン、domain ドメイン (英語: domain) ドメイン (分類学) - 界よりも上位の分類区分。生物の分類参照。 タンパク質ドメイン - ある一つのタンパク質分子は構造上複数の領域に分けることができる場合があり、これらの領域をドメインと呼ぶ。あるいは異なったタンパク質...

SH3ドメイン（Src homology 3 domain）は、約60アミノ酸残基からなる小さなタンパク質ドメインである。当初、SH3はウイルスのアダプタータンパク質v-Crk中の保存配列として記載された。このドメインはホスホリパーゼや、Abl（英語版）やSrcなど細胞質のいくつかのチロシンキナーゼ...

Glaドメイン（gamma-carboxyglutamic (Gla) domain）は、グルタミン酸残基からγ-カルボキシグルタミン酸（Gla）への翻訳後修飾を含むタンパク質ドメインである。Gla残基は、グルタミン酸残基のビタミンK依存的なカルボキシル化によって形成される。このドメインを含むタンパク質...

膜貫通型ドメイン（まくかんつうがたドメイン、英: transmembrane domain、TMD）は、膜貫通ドメインとも呼ばれ、細胞膜を貫通するタンパク質ドメインである。TMDは一般的にαヘリックスのトポロジー構造をとるが、ポリンのように異なる構造をとるものもある。脂質二重層の内部は疎水性であるた...

GEF）とは、GTP結合タンパク質（GTPアーゼ）上に結合しているグアノシン二リン酸（GDP）の放出を促進してグアノシン三リン酸（GTP）を結合させることによって、GTPアーゼの活性化を行うタンパク質またはタンパク質ドメインのことである。様々な関連のない構造ドメイン...

C末端ドメイン(CTD)に特別な機能があるタンパク質もある。 RNAポリメラーゼ RNAポリメラーゼIIのC末端ドメインは、Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser配列の52回の繰り返しで構成される。このC末端ドメインにはしばしばポリメラーゼを活性化するタンパク質...

る。これはシートが極性（水性環境）と非極性（油性環境）の境界を形成する場合に有用である。 コラーゲンヘリックス フォルダマー タンパク質フォールディング タンパク質ドメイン 三次構造 αヘリックス 構造モチーフ ^ Voet, Donald; Voet, Judith G. (2004). Biochemistry...

P糖タンパク質（Pとうタンパクしつ、英: P-glycoprotein, P-gp, Pgp）は、分子量約18万のリン酸化タンパク質であり、細胞膜上に存在して細胞毒性を有する化合物などの細胞外排出を行う。P-gpはABC輸送体のMDR/TAPサブファミリーに属する分子であり、腸や肺、腎臓の近位尿細管...

EGF様ドメイン（英: EGF-like domain）または単にEGFドメイン（英: EGF domain）とは進化的に保存されたタンパク質ドメインであり、その名称は最初に記載が行われたタンパク質である上皮成長因子（EGF）に由来する。30から40アミノ酸残基程度の長さであり、多数のタンパク質...

タウタンパク質（タウタンパクしつ、英: Tau protein）は、微小管を安定化するタンパク質である。ギリシャ文字の τ（タウ）を用いて、τタンパク質と表記されることもある。タウタンパク質は中枢神経系の神経細胞に豊富に存在するが、他の部位では一般的ではない。中枢神経系のアストロサイトやオリゴデン...