ヘリックス、5残基ごとのものはΠヘリックスと呼ばれる。αヘリックス以外のヘリックス構造はあまり見られないが、310ヘリックスはαヘリックスの末端部で見られることがある。水素結合が2残基ごとの不安定なヘリックス(δヘリックスと呼ばれることがある)が、αヘリックス...
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ヘリックスターンヘリックス(Helix-turn-helix、HTH)とは、タンパク質の主要な構造モチーフの一つで、DNAに結合する性質を持つ。2つのαヘリックスが短いペプチド鎖で繋がった構造を持ち、遺伝子発現を制御するタンパク質に特に多く見られる。 このモチーフは、Cro、CAP、λリプレッサー...
2 KB (263 words) - 21:40, 2 April 2014
最も一般的な二次構造はαヘリックスとβシートである。310ヘリックスおよびπヘリックスといったその他のらせんはエネルギー的に好ましい水素結合パターンを持つと計算されるが、ヘリックスの中心における不利な主鎖の詰め込みのためαヘリックスの末端を除いては天然のタンパク質ではめったに見られない。ポリプロリンヘリックスおよびα...
31 KB (3,923 words) - 08:53, 22 December 2022
ヘリックスだと3残基先の、αヘリックスだと4残基先のアミノ酸との結合になる。 πヘリックスの残基の二面角 (φ, ψ) は、(-55°, -70°) に近い値を取るが、実は二面角の合計が-125°となるような値を取りうる。これと比べ、310ヘリックスだと二面角の合計はおよそ-75°、αヘリックス...
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タンパク質 (category プロテオミクス)
(folding) とも呼ばれる。結合エネルギーが比較的低いため、簡単な処理によって構造を変性させやすい。 タンパク質はαヘリックスやβシートといった二次構造の特定の組み合わせが局部的に集合し形成されたαヘアピンやβヘアピンなどの超二次構造と呼ばれる単位ができて核に纏まったドメインをとり、タンパク質全体としての...
51 KB (6,924 words) - 23:13, 4 July 2024
αヘリックスから構成されている。αヘリックスをつなぐループは、細胞外ドメインと細胞内ドメインを形成している。大きなペプチドリガンドの結合部位は、通常、細胞外ドメインに位置し、小さな非ペプチドリガンドの結合部位は、7つのαヘリックス...
31 KB (3,458 words) - 04:42, 19 July 2024
アポジカα 、第一製薬が販売している育毛剤。 アルファ粒子 、アルファ線 アルファ波 アルファレコード αヘリックス:タンパク質の二次構造の共通モチーフの一つ。 α巻きヘリカルスキャン VTRのテープ走行レイアウトの方式。↔Ω巻き アルファチャンネル チャンネルα ジェネレーションα(α世代) DEC...
5 KB (598 words) - 13:03, 13 September 2021
αヘリックスだと4つ前、πヘリックスだと5つ前のアミノ酸と水素結合を作ることになる。 この結合を作るアミノ酸残基の二面角 (φ, ψ) は、(-49°, -26°) に近い値を取るが、実はφとψの合計が-75°になるような値を取りうる。これと比べて、αヘリックス...
2 KB (284 words) - 00:35, 15 May 2022
ヘリックスバンドル(Helix bundle)は、平行、または逆平行のいくつかのαヘリックスで構成される小さなタンパク質の三次構造である。 3ヘリックスバンドルは三次構造のうち最も小さく、最も早くから知られていたものである。villinヘッドピースにある3ヘリックス...
4 KB (540 words) - 11:36, 28 December 2023
きる。これはシートが極性(水性環境)と非極性(油性環境)の境界を形成する場合に有用である。 コラーゲンヘリックス フォルダマー タンパク質フォールディング タンパク質ドメイン 三次構造 αヘリックス 構造モチーフ ^ Voet, Donald; Voet, Judith G. (2004). Biochemistry...
28 KB (3,659 words) - 21:19, 7 April 2024
名がある。この準粒子は、筋収縮における分子の機構を説明するために提唱されたものであり、αヘリックスと結びついている。 ^ 右衛門佐 重雄. “生体系におけるソリトン”. Ceek.jp Altmetrics (α ver.). 日本物理學會誌. 日本物理学会. 2022年9月3日閲覧。 表示 編集...
890 bytes (89 words) - 07:01, 20 October 2023
ねじの山と溝 つる植物のつる 螺旋階段 ソレノイド コイル コイルばね ドリル 螺旋状の分子 DNA分子 アミロース分子(でんぷんの一種) タンパク質のαヘリックス構造 スクリューやプロペラの軌跡 三色ねじり棒(理容店のサイン) 銃および砲における、回転により弾道を安定させ直進性を図るためのライフリング(溝)...
8 KB (872 words) - 04:29, 28 December 2023
持つ。ジンクフィンガーは2つの逆平行βシートと1つのαヘリックスからなる。小さすぎて疎水中心を持たないため亜鉛イオンが安定化にとって重要である。 最もよく研究されたC2H2クラスのジンクフィンガーでは、βシートの2つのシステイン残基とαヘリックスの2つのヒスチジン残基が亜鉛イオンとの結合に関わって...
3 KB (376 words) - 23:35, 4 May 2024
コイルドコイル(英語: coiled coil)はタンパク質の構造モチーフの1つで、2つから7つのαヘリックスがロープのように巻いた形をしている。コイルドコイル構造を持つタンパク質には、遺伝子発現を制御するものや転写因子など、重要な生物学的機能を持つものが多い。代表的なものにがん遺伝子由来のc-fo...
6 KB (819 words) - 14:00, 23 August 2024
ロイシンジッパーの半分は短いαヘリックスからなっている。通常のαヘリックス1巻きが3.6残基となっているのに対し、ロイシンジッパーのαヘリックスの場合は1巻きあたり3.5残基となっている。ロイシンは2巻きごとにもう一方の鎖のロイシンと直接接触している。 bZip(ベーシック...
3 KB (383 words) - 13:01, 12 June 2021
膜貫通型タンパク質 (section αヘリックス膜貫通型タンパク質の安定性)
膜貫通型αヘリックスタンパク質は、膜内で完全にアンフォールディング(unfolding; 折り畳みの展開)しないため、熱変性の研究から判断すると非常に安定している (完全にアンフォールディングするには、非極性媒体中であまりにも多くのαヘリックス...
24 KB (3,041 words) - 20:38, 19 January 2024
やはりアミンと同じように相互変換が起こるようになる。 タンパク質の構造は以下の四段階に分けて考える事が多い。 一次構造:アミノ酸配列 二次構造:αヘリックス、βシート、ターン 三次構造:タンパク質の折りたたみ(フォールディング) 四次構造:複数のタンパク質の結合(サブユニット間相互作用) 例外的な単位としては以下のものがある。...
15 KB (2,426 words) - 05:01, 19 July 2024
ヘリックスターンヘリックスは似た名称であるが異なる構造である。 bHLHモチーフはループでつながれた2本のα-ヘリックスによって特徴づけられる。このモチーフを持つ転写因子は二量体を形成し、塩基性アミノ酸残基を含むヘリックスがDNAに結合する 。一般的に、短い方のヘリックス...
12 KB (1,603 words) - 02:58, 24 December 2022
ロイシンリッチリピート(Leucine-rich repeat)はタンパク質の構造モチーフの1つで、αヘリックスとβシートからなる馬蹄の形をしている。20-30残基のアミノ酸の繰り返し配列で、疎水性のロイシンの割合が多い。それぞれの繰り返しはβシート-ターン-αヘリックス...
2 KB (222 words) - 05:41, 24 November 2018
をしている。これは単独でリボンとしても、より複雑なβシートの一部としても現れる。他の超二次構造の例としてはβ-α-βモチーフがあり、平行βストランドの繋ぎ目でよく見られる。中央のαヘリックスが1番目のストランドのC末端と2番目のストランドのN末端を結合する。 いくつかのモチーフが一体となり、局所的に...
39 KB (6,121 words) - 01:14, 18 December 2022
タンパク質構造予測 (category バイオインフォマティクス)
データベースに追加されている。CATHデータベースでは、All-α、All-β、α-βの3つのクラスがあり、α-βクラスには交互型のα/β構造と分離型のα+β構造の両方が含まれる。 コア 折りたたまれたタンパク質分子のうち、αヘリックスとβシートの疎水性内部を構成する部分。コンパクトな構造により、ア...
77 KB (10,894 words) - 08:43, 3 April 2024
transmembrane domain、TMD)は、膜貫通ドメインとも呼ばれ、細胞膜を貫通するタンパク質ドメインである。TMDは一般的にαヘリックスのトポロジー構造をとるが、ポリンのように異なる構造をとるものもある。脂質二重層の内部は疎水性であるため、TMDのアミノ酸残基は疎水性であることが...
10 KB (1,438 words) - 08:06, 19 July 2024
αソレノイド(Alpha solenoid)はタンパク質フォールドの1つで、葉緑体の光捕集系複合体のサブユニットに見られる。特に渦鞭毛藻のペリジニンやクロロフィルを含むタンパク質や、真核生物の核膜孔複合体を作るタンパク質のドメインに見られる。αヘリックスが曲線状に配列した構造で、ジェリーロールの形...
1 KB (114 words) - 08:55, 16 March 2019
ん構造を取ると、ピロリドン環は鎖間を広げ、αヘリックスよりも開いた構造を保つ。3本の鎖は水素結合により繋がっているが、水素原子の供給源はグリシンのアミノ基であり、受容源は他の鎖の残基のカルボキシル基である。ヒドロキシプロリンのカルボキシル基も水素結合に関与している。 三次構造 αヘリックス βシート...
1 KB (172 words) - 22:01, 2 April 2014
ヘリックス(Helix)は、螺旋(3次元曲線)を意味する英語。 Ka-27 (航空機) - ヘリコプター αヘリックス - たんぱく質の構造の1つ ヘリックス属 - カタツムリの1属。エスカルゴなどが属する。 らせん星雲 - みずがめ座の惑星状星雲 ヘリックスコイル - コイルの一種 HELIX -...
887 bytes (155 words) - 09:21, 8 October 2022
EFハンド(EF Hand)はタンパク質の二次構造のモチーフの1つである。互いにおよそ垂直になっている2つのαヘリックスからなり、しばしばカルシウムイオンを結合した、12アミノ酸残基程度の短いリンカーループで繋がっている。名前は、3つのEFハンドモチーフを持ち、カルシウム結合活性により筋肉の弛緩に関...
2 KB (267 words) - 05:15, 24 November 2018
インターロイキン-5 (category ISBNマジックリンクを使用しているページ)
αヘリックス構造からなるヘリックスバンドル構造を含み、それぞれのα-ヘリックスはアミノ基側末端からA,B,C及びDと呼ばれる。各ヘリックス間にはループ構造がはさまれており、ヘリックスAとヘリックスB、ヘリックスCとヘリックスDはやや長めのループ1及びループ3によりつながれている。一方で、ヘリックス...
7 KB (1,204 words) - 15:56, 4 December 2023
TIMバレル(TIM barrel)は、8つのαヘリックスと8つの平行βシートからなるタンパク質フォールドである。トリオースリン酸イソメラーゼ(Triosephosphateisomerase)の頭文字を取って命名された。現在では、TIMバレルは沢山のタンパク質で見られ、タンパク質の中でも主に酵素中...
2 KB (298 words) - 05:45, 24 November 2018
グロビンフォールド (section ヘリックスパッキング)
α型の三次構造に分類される。 一次構造上でヘリックスを構成するアミノ酸同士が近くにある場合の多くは空間的にも近接し局部構造を作るが、そのような他の構造モチーフとは異なり、グロビンフォールドを構成する8つのαヘリックスはほとんど局所構造を持たない。グロビンフォールドのヘリックス同士は、ヘリックス...
2 KB (310 words) - 22:04, 2 April 2014
ており、カルボニル基はシートと順方向、アミノ基はシートと逆方向を向いている。そのためαシートは元々電荷を持っていて、カルボニル基の向いている方がマイナス、アミノ基の向いている方がプラスに帯電している。またαヘリックスやβシートなどと異なり、立体配置的にどのアミノ酸でも取れるわけではない。また天然のタ...
9 KB (1,237 words) - 11:37, 29 December 2023
アスパラギン (category Α-アミノ酸)
アスパラギンの側鎖はペプチド骨格と水素結合を形成することができる。つまり、他のペプチド骨格の代わりに水素結合サイトを埋めることができる。そのため、この残基はαヘリックスの始点、終点、βシートのターンで見られる。構造の類似したグルタミンは立体配座エントロピーが大きいため、このような機能は持たない。...
6 KB (540 words) - 22:20, 15 July 2024