Мно́жественное выра́внивание после́довательностей (англ. multiple sequence alignment, MSA) — выравнивание трёх и более биологических последовательностей...
54 KB (4,408 words) - 07:35, 1 October 2023
поиск родственных последовательностей в базе данных нуклеотидных и аминокислотных последовательностей Clustal — множественное выравнивание нуклеотидных и...
51 KB (3,119 words) - 08:03, 11 September 2024
Выра́внивание после́довательностей — биоинформатический метод, основанный на размещении двух или более последовательностей мономеров ДНК, РНК или белков...
43 KB (2,998 words) - 15:05, 2 June 2024
остатков, пространственное выравнивание не требует никаких предварительных данных, кроме координат атомов. Пространственное выравнивание подходит для сравнения...
39 KB (3,425 words) - 07:20, 13 July 2019
гомологичных последовательностей. Она представляет собой результат множественного выравнивания последовательностей, в которых гомологичные последовательности сравниваются...
12 KB (766 words) - 08:09, 8 October 2023
UGENE (section Редактор последовательностей)
нуклеотидных и белковых последовательностей. Быстрый поиск в последовательности Множественное выравнивание последовательностей: ClustalW, ClustalO, MUSCLE...
23 KB (1,125 words) - 14:20, 20 May 2024
подходы испытывают трудности с использованием точных множественных выравниваний последовательностей, поскольку геномы, даже близко родственных видов значительно...
84 KB (5,892 words) - 07:47, 4 November 2024
для следующих функций: выполнить множественное выравнивание последовательностей; посмотреть на результаты выравнивания; внести правки, если это необходимо...
10 KB (622 words) - 21:47, 22 August 2024
для любых последовательностей — для последовательностей целых чисел, для последовательностей строк, для последовательностей последовательностей булевых...
40 KB (2,327 words) - 06:28, 24 April 2024
доменов. Каждое семейство в ней представлено множественным выравниванием фрагментов белковых последовательностей и скрытой марковской моделью (HMM). На март...
20 KB (1,310 words) - 19:21, 20 May 2024
пангеном. Методы дальнейшего анализа могут включать в себя множественное выравнивание последовательностей универсальной части пангенома, реконструкцию филогении...
55 KB (3,918 words) - 08:09, 13 December 2024
Гомология (биология) (redirect from Гомологичные последовательности ДНК)
анализ последовательностей нуклеотидов в ДНК и аминокислот в белках потребовал развития традиционного понятия гомологии. При анализе последовательностей принято...
39 KB (2,189 words) - 09:50, 3 August 2024
других лигандов. Для создания логотипа набора последовательностей в начале производится их локальное выравнивание, по необходимости — относительно какой-то...
18 KB (1,111 words) - 23:17, 16 August 2024
экспериментальная компьютерная игра об оптимизации множественного выравнивания последовательностей. Изначально была разработана в центре биоинформатики...
4 KB (242 words) - 13:23, 22 June 2019
предсказанию консенсусных структур: Укладка выравнивания; Одновременное выравнивание последовательностей и укладка; Выравнивание предсказанных структур. Данный подход...
25 KB (2,256 words) - 03:01, 26 October 2023
Предсказание структуры белка (section Коэволюционирующие последовательности в предсказании контактов в 3D)
1990-х годах, несколько групп исследователей использовали выравнивание белковых последовательностей для предсказания коррелированных мутаций, и была надежда...
87 KB (6,781 words) - 09:38, 9 January 2025
соответствует большей схожести последовательностей). Матрица BLOSUMn вычислена на основе выравнивания последовательностей, сходных не более, чем на n%....
44 KB (3,939 words) - 21:03, 26 July 2024
выравнивает полученные в результате РНК-секвенирования фрагменты последовательностей РНК — прочтения («риды») — на референсный[англ.] геном и определяет...
27 KB (1,887 words) - 20:09, 14 November 2023
алгоритм, основанный на применении скрытых марковских моделей ко множественным выравниваниям. По данным на январь 2012 года SMART содержала модели 1009 доменов...
4 KB (257 words) - 23:03, 22 August 2024
белков Структура белков Белковые домены Подсемейство белков Выравнивание последовательностей Dayhoff M. O. Computer analysis of protein sequences. (англ...
13 KB (832 words) - 10:41, 15 December 2022
Метагеномика (section Сборка последовательностей)
участки таких последовательностей геномной ДНК, как например ген, кодирующий 16S рРНК, состоят из высококонсервативных последовательностей и гипервариабельных...
60 KB (5,729 words) - 06:42, 24 November 2024
применяемых в биоинформатике: метод ближайших соседей, глобальное выравнивание последовательностей (Алгоритм Нидлмана — Вунша) и парсинг результатов BLAST. Язык...
171 KB (11,226 words) - 08:03, 22 January 2025
биологических последовательностях. ПВМ может быть построена на основе множественного выравнивания родственных последовательностей, или последовательностей, выполняющих...
29 KB (2,746 words) - 23:19, 16 August 2024
Предсказание генов (section Множественные информанты)
сходства последовательностей», обнаруживают гены путем выравнивания известных последовательностей кДНК и белка по нехарактеризованным последовательностям генома...
33 KB (2,886 words) - 03:19, 14 September 2024
Go (section Оператор множественного выбора)
включая неиспользуемую память, которая может появляться в структурах из-за выравнивания; unsafe.Alignof() — аргументом может быть выражение любого типа, функция...
172 KB (12,323 words) - 09:13, 23 January 2025
существительные и прилагательные, окончания прошли морфологические выравнивания к -e. Английское множественное число с окончанием на -en уступило окончанию -s (сохранились...
105 KB (6,774 words) - 20:33, 18 October 2024
данных геномных последовательностей. Источником информации для предсказания могут служить гомология нуклеотидных последовательностей, профили экспрессии...
26 KB (2,658 words) - 16:59, 17 October 2022
методы дают в качестве выходных данных таблицу последовательностей ДНК и количество различных последовательностей на образец. Другим важным шагом в анализе...
104 KB (6,686 words) - 22:16, 3 December 2024
шведском языке. В некоторых языках предложены дополнительные шкалы для выравнивания различий в образовании испытуемых. В то же время, не все языковые версии...
19 KB (1,451 words) - 00:23, 17 July 2022
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico (section По набору исследуемых последовательностей)
последовательностей на современном настольном компьютере или ноутбуке. ChIPMunk итеративно ищет безделеционное множественное локальное выравнивание с...
58 KB (4,510 words) - 05:11, 26 July 2022
количество последовательностей мотивов оставалось достаточно малым. К концу 1970-х годов появилось множество примеров мутантных последовательностей (сайтов)...
93 KB (5,847 words) - 07:31, 11 October 2024