Мно́жественное выра́внивание после́довательностей (англ. multiple sequence alignment, MSA) — выравнивание трёх и более биологических последовательностей...
54 KB (4,408 words) - 07:35, 1 October 2023
поиск родственных последовательностей в базе данных нуклеотидных и аминокислотных последовательностей Clustal — множественное выравнивание нуклеотидных и...
51 KB (3,119 words) - 08:03, 11 September 2024
Выра́внивание после́довательностей — биоинформатический метод, основанный на размещении двух или более последовательностей мономеров ДНК, РНК или белков...
43 KB (2,998 words) - 15:05, 2 June 2024
остатков, пространственное выравнивание не требует никаких предварительных данных, кроме координат атомов. Пространственное выравнивание подходит для сравнения...
39 KB (3,425 words) - 07:20, 13 July 2019
гомологичных последовательностей. Она представляет собой результат множественного выравнивания последовательностей, в которых гомологичные последовательности сравниваются...
12 KB (766 words) - 08:09, 8 October 2023
UGENE (section Редактор последовательностей)
нуклеотидных и белковых последовательностей. Быстрый поиск в последовательности Множественное выравнивание последовательностей: ClustalW, ClustalO, MUSCLE...
23 KB (1,125 words) - 14:20, 20 May 2024
подходы испытывают трудности с использованием точных множественных выравниваний последовательностей, поскольку геномы, даже близко родственных видов значительно...
84 KB (5,892 words) - 07:47, 4 November 2024
для следующих функций: выполнить множественное выравнивание последовательностей; посмотреть на результаты выравнивания; внести правки, если это необходимо...
10 KB (622 words) - 21:47, 22 August 2024
для любых последовательностей — для последовательностей целых чисел, для последовательностей строк, для последовательностей последовательностей булевых...
40 KB (2,327 words) - 06:28, 24 April 2024
доменов. Каждое семейство в ней представлено множественным выравниванием фрагментов белковых последовательностей и скрытой марковской моделью (HMM). На март...
20 KB (1,310 words) - 19:21, 20 May 2024
пангеном. Методы дальнейшего анализа могут включать в себя множественное выравнивание последовательностей универсальной части пангенома, реконструкцию филогении...
55 KB (3,918 words) - 08:09, 13 December 2024
экспериментальная компьютерная игра об оптимизации множественного выравнивания последовательностей. Изначально была разработана в центре биоинформатики...
4 KB (242 words) - 13:23, 22 June 2019
Гомология (биология) (redirect from Гомологичные последовательности ДНК)
анализ последовательностей нуклеотидов в ДНК и аминокислот в белках потребовал развития традиционного понятия гомологии. При анализе последовательностей принято...
39 KB (2,189 words) - 09:50, 3 August 2024
предсказанию консенсусных структур: Укладка выравнивания; Одновременное выравнивание последовательностей и укладка; Выравнивание предсказанных структур. Данный подход...
25 KB (2,256 words) - 03:01, 26 October 2023
других лигандов. Для создания логотипа набора последовательностей в начале производится их локальное выравнивание, по необходимости — относительно какой-то...
18 KB (1,111 words) - 23:17, 16 August 2024
Предсказание структуры белка (section Коэволюционирующие последовательности в предсказании контактов в 3D)
1990-х годах, несколько групп исследователей использовали выравнивание белковых последовательностей для предсказания коррелированных мутаций, и была надежда...
87 KB (6,781 words) - 09:38, 9 January 2025
соответствует большей схожести последовательностей). Матрица BLOSUMn вычислена на основе выравнивания последовательностей, сходных не более, чем на n%....
44 KB (3,939 words) - 21:03, 26 July 2024
выравнивает полученные в результате РНК-секвенирования фрагменты последовательностей РНК — прочтения («риды») — на референсный[англ.] геном и определяет...
27 KB (1,887 words) - 20:09, 14 November 2023
алгоритм, основанный на применении скрытых марковских моделей ко множественным выравниваниям. По данным на январь 2012 года SMART содержала модели 1009 доменов...
4 KB (257 words) - 23:03, 22 August 2024
белков Структура белков Белковые домены Подсемейство белков Выравнивание последовательностей Dayhoff M. O. Computer analysis of protein sequences. (англ...
13 KB (832 words) - 10:41, 15 December 2022
применяемых в биоинформатике: метод ближайших соседей, глобальное выравнивание последовательностей (Алгоритм Нидлмана — Вунша) и парсинг результатов BLAST. Язык...
171 KB (11,226 words) - 08:03, 22 January 2025
Метагеномика (section Сборка последовательностей)
участки таких последовательностей геномной ДНК, как например ген, кодирующий 16S рРНК, состоят из высококонсервативных последовательностей и гипервариабельных...
60 KB (5,729 words) - 06:42, 24 November 2024
биологических последовательностях. ПВМ может быть построена на основе множественного выравнивания родственных последовательностей, или последовательностей, выполняющих...
29 KB (2,746 words) - 23:19, 16 August 2024
Предсказание генов (section Множественные информанты)
сходства последовательностей», обнаруживают гены путем выравнивания известных последовательностей кДНК и белка по нехарактеризованным последовательностям генома...
33 KB (2,886 words) - 03:19, 14 September 2024
существительные и прилагательные, окончания прошли морфологические выравнивания к -e. Английское множественное число с окончанием на -en уступило окончанию -s (сохранились...
105 KB (6,774 words) - 20:33, 18 October 2024
данных геномных последовательностей. Источником информации для предсказания могут служить гомология нуклеотидных последовательностей, профили экспрессии...
26 KB (2,658 words) - 16:59, 17 October 2022
методы дают в качестве выходных данных таблицу последовательностей ДНК и количество различных последовательностей на образец. Другим важным шагом в анализе...
104 KB (6,686 words) - 22:16, 3 December 2024
Go (section Оператор множественного выбора)
включая неиспользуемую память, которая может появляться в структурах из-за выравнивания; unsafe.Alignof() — аргументом может быть выражение любого типа, функция...
172 KB (12,323 words) - 09:13, 23 January 2025
отсеквенированных последовательностей этих коротких отрезков (прочтений) из них нужно восстановить полный геном или набор последовательностей кДНК. Для этого...
33 KB (2,457 words) - 08:34, 8 August 2022
шведском языке. В некоторых языках предложены дополнительные шкалы для выравнивания различий в образовании испытуемых. В то же время, не все языковые версии...
19 KB (1,451 words) - 00:23, 17 July 2022
количество последовательностей мотивов оставалось достаточно малым. К концу 1970-х годов появилось множество примеров мутантных последовательностей (сайтов)...
93 KB (5,847 words) - 07:31, 11 October 2024