Kyanoviridae – Wikipedia

Kyanoviridae
EM-Aufnahmen von Virionen der Pro­chloro­coccus-Cyano­phagen P-SSM2 (Gat­tung Salacisa­virus; oben) und P-SSM4 (Gat­tung Ronodor­virus; unten)
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Duplodnaviria Reich: Heunggongvirae Phylum: Uroviricota Klasse: Caudoviricetes Ordnung: incertae sedis Familie: Kyanoviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear Baltimore: Gruppe 1 Symmetrie: ikosaedrisch, tailed (Myoviren)
Wissenschaftlicher Name
Kyanoviridae
Links
ICTV Taxon History: 202213665 NCBI Taxonomy: 2946160

Kyanoviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren mit sog. Kopf-Schwanz-Aufbau (Klasse Caudoviricetes), die Cyanobakterien infizieren (solche bakteriellen Viren werden auch Bakteriophagen, genauer Cyanophagen, genannt). Die Familie wurde im März/April 2022 vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) eingerichtet.^[1]

Diese Familie wurde vom ICTV eingerichtet, um alle T4-ähnlichen Cyanophagen zusammenzufassen. Die T4-ähnlichen Phagen, die dagegen histotrophe Bakterien^{[A. 1]} infizieren, wurden stattdessen in der Familie Straboviridae zusammengefasst. Phylogenetische Analysen zeigen eine tiefe Verzweigung zwischen den seinerzeit neu gebildeten Familien Straboviridae und Kyanoviridae.^[2]

Der Name der Familie Kyanoviridae leitet sich ab von ihren Wirten, den Cyanobakterien (altgriechisch κύανος kyanos, deutsch ‚blau‘, ‚cyan‘): versehen mit dem Suffix ‚-viridae‘ für Virusfamilien.^[1][2]

Innere Systematik der Familie Kyanoviridae gemäß International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand Mai/Juni 2024:^[3][4][2]

Familie Kyanoviridae (54 Gattungen)^[5]

• Gattung Acionnavirus
  • Spezies Acionnavirus monteraybay (Synechococcus-Virus SMbCM100), mit

    Synechococcus phage S-MbCM100 (Synechococcus-Phage S-MbCM100, Referenz, „Exemplar“)

    Synechococcus phage ACG-2014a (Synechococcus-Phage ACG-2014a)

• Gattung Ahtivirus
  • Spezies Ahtivirus sagseatwo (Synechococcus-Virus SShM2), mit

    Synechococcus phage S-ShM2 (Synechococcus-Phage S-ShM2, Referenz, „Exemplar“)

    Cyanophage S-RIM14

    Cyanophage S-SSM2

• Gattung Alisovirus
  • Spezies Alisovirus socal22, mit Synechococcus phage S-CAM22 (Synechococcus-Phage S-CAM22)

• Gattung Anaposvirus
  • Spezies Anaposvirus socalone (Synechococcus-Virus SCAM1), mit Synechococcus phage S-CAM1 (Synechococcus-Phage S-CAM1)

• Gattung Atlauavirus
  • Spezies Atlauavirus acg2014f (Synechococcus-Virus ACG2014f), mit Synechococcus phage ACG-2014f_Syn7803C7
  • Spezies Atlauavirus caeruleum (Synechococcus-Virus ACG2014fSyn7803US26), mit Synechococcus phage ACG-2014f_Syn7803US26
  • Spezies Atlauavirus tusconc8 (Synechococcus-Virus AC2014fSyn7803C8), mit Synechococcus phage ACG-2014f_Syn7803C8

• Gattung Bellamyvirus
  • Spezies Bellamyvirus bellamy (Synechococcus-Virus Bellamy), mit Synechococcus phage Bellamy

• Gattung Bristolvirus
  • Spezies Bristolvirus rhodeisland, mit Cyanophage S-RIM32

• Gattung Brizovirus
  • Spezies Brizovirus rhodeisland01, mit Cyanophage S-RIM12 isolate RW_01_0310
  • Spezies Brizovirus rhodeisland06, mit Cyanophage S-RIM12 isolate RW_06_0310
  • Spezies Brizovirus syn33 (Prochlorococcus-Virus Syn33), mit Prochlorococcus phage Syn33

• Gattung Chalconvirus
  • Spezies Chalconvirus acg2014e, mit Synechococcus phage ACG-2014e
  • Spezies Chalconvirus acg2014i, mit Synechococcus phage ACG-2014i

• Gattung Charybdisvirus
  • Spezies Charybdisvirus scam3 (Synechococcus-Virus SCAM3), mit Synechococcus phage S-CAM3

• Gattung Cymopoleiavirus
  • Spezies Cymopoleiavirus swam2 (Synechococcus-Virus SWAM2), mit Synechococcus phage S-WAM2

• Gattung Emcearvirus
  • Spezies Emcearvirus gerard, mit Cyanophage P-RSM1

• Gattung Galenevirus
  • Spezies Galenevirus mbcm1, mit Synechococcus phage metaG-MbCM1

• Gattung Gibbetvirus
  • Spezies Gibbetvirus rsm4, mit Synechococcus phage S-RSM4 (Synechococcus-Phage S-RSM4)

• Gattung Glaucusvirus
  • Spezies Glaucusvirus ssm5, mit Synechococcus phage S-SSM5 (Synechococcus-Phage S-SSM5)

• Gattung Greenvirus
  • Spezies Greenvirus ssm4 (Synechococcus-Virus SSM4), mit Synechococcus phage S-SSM4 (Synechococcus-Phage S-SSM4)^[6]
  • Spezies „Cyanophage S-SSM6b“ (syn. „Cyanophage 8109-2b“)

• Gattung Haifavirus
  • Spezies Haifavirus tim68, mit Prochlorococcus phage P-TIM68 (Prochlorococcus-Phage P-TIM68)

• Gattung Huanghaivirus^[7]
  • Spezies Huanghaivirus snothree, mit Synechococcus phage S-N03 (Synechococcus-Phage S-N03)

• Gattung Kanaloavirus
  • Spezies Kanaloavirus scam9, mit Synechococcus phage S-CAM9

• Gattung Leucotheavirus
  • Spezies Leucotheavirus sp4 (Synechococcus-Virus SP4), mit Synechococcus phage S-P4
  • Spezies Leucotheavirus syn30 (Synechococcus-Virus Syn30), mit Synechococcus phage Syn30

• Gattung Libanvirus
  • Spezies Libanvirus ptim40, mit Cyanophage P-TIM40

• Gattung Lipsvirus
  • Spezies Lipsvirus ssm7, mit Synechococcus phage S-SSM7 (Synechococcus-Phage S-SSM7)

• Gattung Lowelvirus
  • Spezies Lowelvirus tuscon4d, mit Synechococcus phage ACG-2014d

• Gattung Macariavirus
  • Spezies Macariavirus tuscon14g, mit Synechococcus phage ACG-2014g

• Gattung Makaravirus
  • Spezies Makaravirus thirtyfour, mit Synechococcus phage S-H34

• Gattung Makelovirus
  • Spezies Makelovirus prm1 (Synechococcus virus S-PRM1) mit Cyanophage S-PRM1

• Gattung Mazuvirus
  • Spezies Mazuvirus scam7, mit Synechococcus phage S-CAM7 isolate 0910CC49

• Gattung Namakavirus
  • Spezies Namakavirus smbcm6, mit Synechococcus phage S-MbCM6

• Gattung Neptunevirus
  • Spezies Neptunevirus srim18 (Synechococcus-Virus SRIM8), mit Synechococcus phage S-RIM8
  • Spezies Neptunevirus srim50 (Synechococcus-Virus SRIM50), mit Cyanophage S-RIM50

• Gattung Nereusvirus
  • Spezies Nereusvirus tusconc4 (Synechococcus-Virus ACG2014bSyn9311C4), mit Synechococcus phage ACG-2014b
  • Spezies Nereusvirus tusconc61 (Synechococcus-Virus ACG2014bSyn7803C61), mit Synechococcus phage ACG-2014b

• Gattung Neritesvirus
  • Spezies Neritesvirus scam8, mit Synechococcus phage S-CAM8

• Gattung Nerrivikvirus
  • Spezies Nerrivikvirus srim2 (Synechococcus-Virus SRIM2), mit Synechococcus phage S-RIM2 [R1_1999]

• Gattung Nilusvirus
  • Spezies Nilusvirus ssm2, mit Synechococcus phage S-SM2 (Synechococcus-Phage S-SM2)

• Gattung Nodensvirus
  • Spezies Nodensvirus spm2 (Synechococcus-Virus SPM2), mit Bacteriophage S-PM2 alias Synechococcus-Phage S-PM2^[8][9]

• Gattung Ormenosvirus
  • Spezies Ormenosvirus syn9, mit Synechococcus phage syn9 (Synechococcus-Phage syn9) alias Bacteriophage Syn9 oder Cyanophage Syn9^[10][11]
  • Spezies „Cyanophage Syn10“

• Gattung Palaemonvirus
  • Spezies Palaemonvirus pssm7 (Prochlorococcus-Virus PSSM7), mit Prochlorococcus phage P-SSM7

• Gattung Pontusvirus
  • Spezies Pontusvirus syn19, mit Synechococcus phage Syn19

• Gattung Potamoivirus
  • Spezies Potamoivirus cam4, mit Synechococcus phage S-CAM4
  • Spezies Potamoivirus tusconj, mit Synechococcus phage ACG-2014j

• Gattung Ronodorvirus
  • Spezies Ronodorvirus pssm3 (Prochlorococcus-Virus PSSM3), mit

    Prochlorococcus phage P-SSM3

  • Spezies Ronodorvirus ssm4 (Prochlorococcus-Virus PSSM4), mit^[12][9]

    Prochlorococcus phage P-SSM4 alias Cyanophage P-SSM4 (Referenz, „Exemplar“)

    Cyanophage P-RSM3

    Cyanophage P-SS1

• Gattung Salacisavirus
  • Spezies Salacisavirus pssm2 (Prochlorococcus-Virus PSSM2, früher Myovirus P-SSM2),^[16][17][18] mit

    Prochlorococcus phage P-SSM2 (Prochlorococcus-Phage) P-SSM2 alias Cyanophage P-SSM2^[9] – Subtyp Phage P-SSM2 Fd – Fd wie Ferredoxin, Wirt: Prochlorococcus marinus^[19][20]

    Prochlorococcus phage P-SSM5

• Gattung Scyllavirus
  • Spezies Scyllavirus aitchnine, mit Synechococcus phage S-H9-1

• Gattung Sedonavirus
  • Spezies Sedonavirus tusconh, mit Synechococcus phage ACG-2014h

• Gattung Serangoonvirus
  • Spezies Serangoonvirus essarone, mit Synechococcus phage S-SRM01

• Gattung Shandvirus
  • Spezies Shandvirus sb64, mit Synechococcus phage S-B64
  • Spezies Shandvirus sh35, mit Synechococcus phage S-H35

• Gattung Shenzhenivirus
  • Spezies Shenzhenivirus sszbm1, mit Synechococcus phage S-SZBM1

• Gattung Sokavirus
  • Spezies Sokavirus swam1, mit Synechococcus phage S-WAM1

• Gattung Tamkungvirus
  • Spezies Tamkungvirus ST4, mit Synechococcus phage S-T4

• Gattung Tefnutvirus
  • Spezies Tefnutvirus siom18, mit Synechococcus phage S-IOM18

• Gattung Thaumasvirus
  • Spezies Thaumasvirus stim4, mit Cyanophage S-TIM4

• Gattung Thetisvirus (wohl zu unterscheiden von der Gattung Thetysvirus der Unterfamilie Mesomimiviridae , Fam. Mimiviridae)
  • Spezies Thetisvirus ssm1 (Synechococcus-Virus SSM1), mit Synechococcus phage S-SM1 (Synechococcus-Phage S-SM1) alias Cyanophage S-SM1^[21][17][18]

• Gattung Vellamovirus
  • Spezies Vellamovirus rhodeisland44 (Synechococcus-Virus SRIM44), mit Cyanophage S-RIM44
  • Spezies Vellamovirus syn1 (Prochlorococcus-Virus Syn1), mit Prochlorococcus phage Syn1 (Prochlorococcus-Phage Syn1)

• Gattung Yellowseavirus^[7]
  • Spezies Yellowseavirus thirtyeight, mit Synechococcus phage S-H38 (Synechococcus-Phage S-H38)

• Gattung Yushanluvirus^[7]
  • Spezies Yushanluvirus satich, mit Synechococcus phage S-H9-2 (Synechococcus-Phage S-H9-2)

• Gattung Zhoulongquanvirus^[7]
  • Spezies Zhoulongquanvirus esscess, mit Synechococcus phage S-SCSM1 (Synechococcus-Phage S-SCSM1)

Die Wirte der Kyanoviridae sind Cyanobakterien (Blaugrünbakterien, „Blaualgen“). Dazu gehören Vertreter der Ordnungen Prochlorales^[22] (Gattung Prochlorococcus) und Synechococcales^[23] (Gattung Synechococcus).^{[A. 2][24]}

1. ↑ Unter histotrophen (oder histiotrophen) Bakterien werden solche verstanden, die im Gewebe (insbes. von Tieren wie den Landwirbeltieren) leben und sich dort auf üblicherweise deren Kosten (parasitisch) ernähren, vgl. Histiotrophe.
2. ↑ siehe § Systematik.

• Martha R. J. Clokie, Andrew D. Millard, Nicholas Harold Mann: T4 genes in the marine ecosystem: studies of the T4-like cyanophages and their ro𲀋le in marine ecology. In: Virology Journal, Band 7, Nr. 291, 28. Oktober 2010; doi:10.1186/1743-422X-7-291, ResearchGate (englisch).

1. ↑ ^{a b} ICTV: Taxon Details: Family: Kyanoviridae.
2. ↑ ^{a b c} Andrew Millard, Richard Puxty, Dan White, Lucy Gannon, Christian Harrison, Ryan Cook, Evelien M. Adriaenssens, Dann Turner: Create two new families (Kyanoviridae and Straboviridae) (Caudoviricetes). Vorschlag 2021.082B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).
3. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
4. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
5. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
6. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Greenvirus ssm4 (species).
7. ↑ ^{a b c d} Andrew Millard, Richard Puxty, M. Nicholas: Creation of seven new genera within the family Kyanoviridae (Caudoviricetes) Vorschlag 2022.043B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).
8. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Synechococcus phage S-PM2 (species). NCBI
9. ↑ ^{a b c} John H. Paul, Matthew B. Sullivan: Marine phage genomics: what have we learned? In: Curr. Op. in Biotechnology, Band 16, Nr. 3, Juni 2005, S. 299–307; doi:10.1016/j.copbio.2005.03.007, PMID 15961031, PMC 15961031 (freier Volltext) (englisch); siehe insbes. Fig. 3 (Genomkarte).
10. ↑ Synechococcus phage syn9. NCBI
11. ↑ Cyanophage Syn9. NCBI
12. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Ronodorvirus ssm4 (species), equivalent: Prochlorococcus virus PSSM4.
13. ↑ Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: EurekAlert! vom 26. Mai 2020, Quelle: Rice University.
14. ↑ Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: ScienceDaily vom 26. Mai 2020, Quelle: Rice University.
15. ↑ Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: National Science Foundation (NSF) vom 29. Mai 2020.
16. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Prochlorococcus virus PSSM2 (species).
17. ↑ ^{a b} Denise Brehm: Viruses Use Bacteria for Reproduction. SciTechDaily, 26. Januar 2012
18. ↑ ^{a b} Qinglu Zeng, Sallie W. Chisholm: Marine Viruses Exploit Their Host’s Two-Component Regulatory System in Response to Re​source Limitation. In: Curr Biol, Band 22, Nr. 2, CellPress vom 24. Januar 2012, S. 124–128; doi:10.1016/j.cub.2011.11.055, PDF (englisch), Supplement 1 (PDF; 329 kB)
19. ↑ Ian J. Campbell, Jose Luis Olmos Jr., Weijun Xu, Dimithree Kahanda, Joshua T. Atkinson, Othneil Noble Sparks, Mitchell D. Miller, George N. Phillips Jr., George N. Bennett, Jonathan J. Silberg: ​Prochlorococcus phage ferredoxin: Structural characterization and electron transfer to cyanobacterial sulfite reductases – Phage Fd characterization and host SIR interactions. In: J. Biol. Chem. ASBMB Publications, 19. Mai 2020; doi:10.1074/jbc.RA120.013501 (englisch).
20. ↑ Beneath the Ocean’s Surface, a Virus Is Hijacking the Most Abundant Organism on Earth. Auf: SciTechDaily vom 6. Juni 2020, Quelle: Rice University.
21. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Synechococcus virus S-SM1 (species).
22. ↑ LPSN: Order Prochlorales (ex Lewin 1977) Florenzano et al. 1986.
23. ↑ LPSN: Order "Synechococcales" Hoffmann et al. 2005.
24. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Kyanoviridae, Details: Kyanoviridae (family).