Kyanoviridae – Wikipedia
Kyanoviridae | ||||||||||||||
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EM-Aufnahmen von Virionen der Prochlorococcus-Cyanophagen P-SSM2 (Gattung Salacisavirus; oben) und P-SSM4 (Gattung Ronodorvirus; unten) | ||||||||||||||
Systematik | ||||||||||||||
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Taxonomische Merkmale | ||||||||||||||
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Wissenschaftlicher Name | ||||||||||||||
Kyanoviridae | ||||||||||||||
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Kyanoviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren mit sog. Kopf-Schwanz-Aufbau (Klasse Caudoviricetes), die Cyanobakterien infizieren (solche bakteriellen Viren werden auch Bakteriophagen, genauer Cyanophagen, genannt). Die Familie wurde im März/April 2022 vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) eingerichtet.[1]
Forschungsgeschichte
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Diese Familie wurde vom ICTV eingerichtet, um alle T4-ähnlichen Cyanophagen zusammenzufassen. Die T4-ähnlichen Phagen, die dagegen histotrophe Bakterien[A. 1] infizieren, wurden stattdessen in der Familie Straboviridae zusammengefasst. Phylogenetische Analysen zeigen eine tiefe Verzweigung zwischen den seinerzeit neu gebildeten Familien Straboviridae und Kyanoviridae.[2]
Etymologie
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Der Name der Familie Kyanoviridae leitet sich ab von ihren Wirten, den Cyanobakterien (altgriechisch κύανος kyanos, deutsch ‚blau‘, ‚cyan‘): versehen mit dem Suffix ‚-viridae‘ für Virusfamilien.[1][2]
Systematik
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Innere Systematik der Familie Kyanoviridae gemäß International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand Mai/Juni 2024:[3][4][2]
Familie Kyanoviridae (54 Gattungen)[5]
- Gattung Acionnavirus
- Spezies Acionnavirus monteraybay (Synechococcus-Virus SMbCM100), mit
- Synechococcus phage S-MbCM100 (Synechococcus-Phage S-MbCM100, Referenz, „Exemplar“)
- Synechococcus phage ACG-2014a (Synechococcus-Phage ACG-2014a)
- Spezies Acionnavirus monteraybay (Synechococcus-Virus SMbCM100), mit
- Gattung Ahtivirus
- Spezies Ahtivirus sagseatwo (Synechococcus-Virus SShM2), mit
- Synechococcus phage S-ShM2 (Synechococcus-Phage S-ShM2, Referenz, „Exemplar“)
- Cyanophage S-RIM14
- Cyanophage S-SSM2
- Spezies Ahtivirus sagseatwo (Synechococcus-Virus SShM2), mit
- Gattung Alisovirus
- Spezies Alisovirus socal22, mit Synechococcus phage S-CAM22 (Synechococcus-Phage S-CAM22)
- Gattung Anaposvirus
- Spezies Anaposvirus socalone (Synechococcus-Virus SCAM1), mit Synechococcus phage S-CAM1 (Synechococcus-Phage S-CAM1)
- Gattung Atlauavirus
- Spezies Atlauavirus acg2014f (Synechococcus-Virus ACG2014f), mit Synechococcus phage ACG-2014f_Syn7803C7
- Spezies Atlauavirus caeruleum (Synechococcus-Virus ACG2014fSyn7803US26), mit Synechococcus phage ACG-2014f_Syn7803US26
- Spezies Atlauavirus tusconc8 (Synechococcus-Virus AC2014fSyn7803C8), mit Synechococcus phage ACG-2014f_Syn7803C8
- Gattung Bellamyvirus
- Spezies Bellamyvirus bellamy (Synechococcus-Virus Bellamy), mit Synechococcus phage Bellamy
- Gattung Bristolvirus
- Spezies Bristolvirus rhodeisland, mit Cyanophage S-RIM32
- Gattung Brizovirus
- Spezies Brizovirus rhodeisland01, mit Cyanophage S-RIM12 isolate RW_01_0310
- Spezies Brizovirus rhodeisland06, mit Cyanophage S-RIM12 isolate RW_06_0310
- Spezies Brizovirus syn33 (Prochlorococcus-Virus Syn33), mit Prochlorococcus phage Syn33
- Gattung Chalconvirus
- Spezies Chalconvirus acg2014e, mit Synechococcus phage ACG-2014e
- Spezies Chalconvirus acg2014i, mit Synechococcus phage ACG-2014i
- Gattung Charybdisvirus
- Spezies Charybdisvirus scam3 (Synechococcus-Virus SCAM3), mit Synechococcus phage S-CAM3
- Gattung Cymopoleiavirus
- Spezies Cymopoleiavirus swam2 (Synechococcus-Virus SWAM2), mit Synechococcus phage S-WAM2
- Gattung Emcearvirus
- Spezies Emcearvirus gerard, mit Cyanophage P-RSM1
- Gattung Galenevirus
- Spezies Galenevirus mbcm1, mit Synechococcus phage metaG-MbCM1
- Gattung Gibbetvirus
- Spezies Gibbetvirus rsm4, mit Synechococcus phage S-RSM4 (Synechococcus-Phage S-RSM4)
- Gattung Glaucusvirus
- Spezies Glaucusvirus ssm5, mit Synechococcus phage S-SSM5 (Synechococcus-Phage S-SSM5)
- Gattung Greenvirus
- Spezies Greenvirus ssm4 (Synechococcus-Virus SSM4), mit Synechococcus phage S-SSM4 (Synechococcus-Phage S-SSM4)[6]
- Spezies „Cyanophage S-SSM6b“ (syn. „Cyanophage 8109-2b“)
- Gattung Haifavirus
- Spezies Haifavirus tim68, mit Prochlorococcus phage P-TIM68 (Prochlorococcus-Phage P-TIM68)
- Gattung Huanghaivirus[7]
- Spezies Huanghaivirus snothree, mit Synechococcus phage S-N03 (Synechococcus-Phage S-N03)
- Gattung Kanaloavirus
- Spezies Kanaloavirus scam9, mit Synechococcus phage S-CAM9
- Gattung Leucotheavirus
- Spezies Leucotheavirus sp4 (Synechococcus-Virus SP4), mit Synechococcus phage S-P4
- Spezies Leucotheavirus syn30 (Synechococcus-Virus Syn30), mit Synechococcus phage Syn30
- Gattung Libanvirus
- Spezies Libanvirus ptim40, mit Cyanophage P-TIM40
- Gattung Lipsvirus
- Spezies Lipsvirus ssm7, mit Synechococcus phage S-SSM7 (Synechococcus-Phage S-SSM7)
- Gattung Lowelvirus
- Spezies Lowelvirus tuscon4d, mit Synechococcus phage ACG-2014d
- Gattung Macariavirus
- Spezies Macariavirus tuscon14g, mit Synechococcus phage ACG-2014g
- Gattung Makaravirus
- Spezies Makaravirus thirtyfour, mit Synechococcus phage S-H34
- Gattung Makelovirus
- Spezies Makelovirus prm1 (Synechococcus virus S-PRM1) mit Cyanophage S-PRM1
- Gattung Mazuvirus
- Spezies Mazuvirus scam7, mit Synechococcus phage S-CAM7 isolate 0910CC49
- Gattung Namakavirus
- Spezies Namakavirus smbcm6, mit Synechococcus phage S-MbCM6
- Gattung Neptunevirus
- Spezies Neptunevirus srim18 (Synechococcus-Virus SRIM8), mit Synechococcus phage S-RIM8
- Spezies Neptunevirus srim50 (Synechococcus-Virus SRIM50), mit Cyanophage S-RIM50
- Gattung Nereusvirus
- Spezies Nereusvirus tusconc4 (Synechococcus-Virus ACG2014bSyn9311C4), mit Synechococcus phage ACG-2014b
- Spezies Nereusvirus tusconc61 (Synechococcus-Virus ACG2014bSyn7803C61), mit Synechococcus phage ACG-2014b
- Gattung Neritesvirus
- Spezies Neritesvirus scam8, mit Synechococcus phage S-CAM8
- Gattung Nerrivikvirus
- Spezies Nerrivikvirus srim2 (Synechococcus-Virus SRIM2), mit Synechococcus phage S-RIM2 [R1_1999]
- Gattung Nilusvirus
- Spezies Nilusvirus ssm2, mit Synechococcus phage S-SM2 (Synechococcus-Phage S-SM2)
- Gattung Nodensvirus
- Gattung Ormenosvirus
- Gattung Palaemonvirus
- Spezies Palaemonvirus pssm7 (Prochlorococcus-Virus PSSM7), mit Prochlorococcus phage P-SSM7
- Gattung Pontusvirus
- Spezies Pontusvirus syn19, mit Synechococcus phage Syn19
- Gattung Potamoivirus
- Spezies Potamoivirus cam4, mit Synechococcus phage S-CAM4
- Spezies Potamoivirus tusconj, mit Synechococcus phage ACG-2014j
- Gattung Ronodorvirus
- Gattung Salacisavirus
- Spezies Salacisavirus pssm2 (Prochlorococcus-Virus PSSM2, früher Myovirus P-SSM2),[16][17][18] mit
- Prochlorococcus phage P-SSM2 (Prochlorococcus-Phage) P-SSM2 alias Cyanophage P-SSM2[9] – Subtyp Phage P-SSM2 Fd – Fd wie Ferredoxin, Wirt: Prochlorococcus marinus[19][20]
- Prochlorococcus phage P-SSM5
- Spezies Salacisavirus pssm2 (Prochlorococcus-Virus PSSM2, früher Myovirus P-SSM2),[16][17][18] mit
- Gattung Scyllavirus
- Spezies Scyllavirus aitchnine, mit Synechococcus phage S-H9-1
- Gattung Sedonavirus
- Spezies Sedonavirus tusconh, mit Synechococcus phage ACG-2014h
- Gattung Serangoonvirus
- Spezies Serangoonvirus essarone, mit Synechococcus phage S-SRM01
- Gattung Shandvirus
- Spezies Shandvirus sb64, mit Synechococcus phage S-B64
- Spezies Shandvirus sh35, mit Synechococcus phage S-H35
- Gattung Shenzhenivirus
- Spezies Shenzhenivirus sszbm1, mit Synechococcus phage S-SZBM1
- Gattung Sokavirus
- Spezies Sokavirus swam1, mit Synechococcus phage S-WAM1
- Gattung Tamkungvirus
- Spezies Tamkungvirus ST4, mit Synechococcus phage S-T4
- Gattung Tefnutvirus
- Spezies Tefnutvirus siom18, mit Synechococcus phage S-IOM18
- Gattung Thaumasvirus
- Spezies Thaumasvirus stim4, mit Cyanophage S-TIM4
- Gattung Thetisvirus (wohl zu unterscheiden von der Gattung Thetysvirus der Unterfamilie Mesomimiviridae , Fam. Mimiviridae)
- Gattung Vellamovirus
- Spezies Vellamovirus rhodeisland44 (Synechococcus-Virus SRIM44), mit Cyanophage S-RIM44
- Spezies Vellamovirus syn1 (Prochlorococcus-Virus Syn1), mit Prochlorococcus phage Syn1 (Prochlorococcus-Phage Syn1)
- Gattung Yellowseavirus[7]
- Spezies Yellowseavirus thirtyeight, mit Synechococcus phage S-H38 (Synechococcus-Phage S-H38)
- Gattung Yushanluvirus[7]
- Spezies Yushanluvirus satich, mit Synechococcus phage S-H9-2 (Synechococcus-Phage S-H9-2)
- Gattung Zhoulongquanvirus[7]
- Spezies Zhoulongquanvirus esscess, mit Synechococcus phage S-SCSM1 (Synechococcus-Phage S-SCSM1)
Wirtsspektrum
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Die Wirte der Kyanoviridae sind Cyanobakterien (Blaugrünbakterien, „Blaualgen“). Dazu gehören Vertreter der Ordnungen Prochlorales[22] (Gattung Prochlorococcus) und Synechococcales[23] (Gattung Synechococcus).[A. 2][24]
Anmerkungen
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ↑ Unter histotrophen (oder histiotrophen) Bakterien werden solche verstanden, die im Gewebe (insbes. von Tieren wie den Landwirbeltieren) leben und sich dort auf üblicherweise deren Kosten (parasitisch) ernähren, vgl. Histiotrophe.
- ↑ siehe § Systematik.
Weblinks und Literatur
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- Martha R. J. Clokie, Andrew D. Millard, Nicholas Harold Mann: T4 genes in the marine ecosystem: studies of the T4-like cyanophages and their ro𲀋le in marine ecology. In: Virology Journal, Band 7, Nr. 291, 28. Oktober 2010; doi:10.1186/1743-422X-7-291, ResearchGate (englisch).
Einzelnachweise
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ↑ a b ICTV: Taxon Details: Family: Kyanoviridae.
- ↑ a b c Andrew Millard, Richard Puxty, Dan White, Lucy Gannon, Christian Harrison, Ryan Cook, Evelien M. Adriaenssens, Dann Turner: Create two new families (Kyanoviridae and Straboviridae) (Caudoviricetes). Vorschlag 2021.082B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).
- ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
- ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
- ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Greenvirus ssm4 (species).
- ↑ a b c d Andrew Millard, Richard Puxty, M. Nicholas: Creation of seven new genera within the family Kyanoviridae (Caudoviricetes) Vorschlag 2022.043B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Synechococcus phage S-PM2 (species). NCBI
- ↑ a b c John H. Paul, Matthew B. Sullivan: Marine phage genomics: what have we learned? In: Curr. Op. in Biotechnology, Band 16, Nr. 3, Juni 2005, S. 299–307; doi:10.1016/j.copbio.2005.03.007, PMID 15961031, PMC 15961031 (freier Volltext) (englisch); siehe insbes. Fig. 3 (Genomkarte).
- ↑ Synechococcus phage syn9. NCBI
- ↑ Cyanophage Syn9. NCBI
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Ronodorvirus ssm4 (species), equivalent: Prochlorococcus virus PSSM4.
- ↑ Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: EurekAlert! vom 26. Mai 2020, Quelle: Rice University.
- ↑ Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: ScienceDaily vom 26. Mai 2020, Quelle: Rice University.
- ↑ Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: National Science Foundation (NSF) vom 29. Mai 2020.
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Prochlorococcus virus PSSM2 (species).
- ↑ a b Denise Brehm: Viruses Use Bacteria for Reproduction. SciTechDaily, 26. Januar 2012
- ↑ a b Qinglu Zeng, Sallie W. Chisholm: Marine Viruses Exploit Their Host’s Two-Component Regulatory System in Response to Resource Limitation. In: Curr Biol, Band 22, Nr. 2, CellPress vom 24. Januar 2012, S. 124–128; doi:10.1016/j.cub.2011.11.055, PDF (englisch), Supplement 1 (PDF; 329 kB)
- ↑ Ian J. Campbell, Jose Luis Olmos Jr., Weijun Xu, Dimithree Kahanda, Joshua T. Atkinson, Othneil Noble Sparks, Mitchell D. Miller, George N. Phillips Jr., George N. Bennett, Jonathan J. Silberg: Prochlorococcus phage ferredoxin: Structural characterization and electron transfer to cyanobacterial sulfite reductases – Phage Fd characterization and host SIR interactions. In: J. Biol. Chem. ASBMB Publications, 19. Mai 2020; doi:10.1074/jbc.RA120.013501 (englisch).
- ↑ Beneath the Ocean’s Surface, a Virus Is Hijacking the Most Abundant Organism on Earth. Auf: SciTechDaily vom 6. Juni 2020, Quelle: Rice University.
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Synechococcus virus S-SM1 (species).
- ↑ LPSN: Order Prochlorales (ex Lewin 1977) Florenzano et al. 1986.
- ↑ LPSN: Order "Synechococcales" Hoffmann et al. 2005.
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Kyanoviridae, Details: Kyanoviridae (family).