Die Meistriliiga 2000 war die zehnte Spielzeit der höchsten estnischenFußball-Spielklasse der Herren. Gespielt wurde regulär vom 1. April bis zum 29. Oktober 2000, die beiden Relegationsspiele am 5. und 11. November 2000.[1]
Der FC Levadia Maardu konnte den Titel aus dem Vorjahr eindrucksvoll verteidigen, mit 23 Siegen und 5 Unentschieden hatte er bei keiner Saison eine Niederlage. Es war die zweite Meisterschaft des Vereins in der Geschichte. Mit dem estnischen Pokal konnte man sogar das Double im Jahr 1999 sowie 2000 zweimal in Folge gewinnen. Als amtierender Estnischer Meister scheiterte Levadia in der folgenden Champions League Saison 2001/02 an Bohemians Dublin.
Aufgrund der Auflösung des FC Lantana Tallinn zu Beginn der Saison kam der FC Lootus Kohtla-Järve in die Meistriliiga. Lelle SK wurde vom Vorjahres-Vierplatzierten der Esiliiga, FC Valga, ersetzt. Der FC Kuressaare ging am Ende der Saison in die Relegation, gegen den dem vormaligen Lelle SK, der den Namen JK Pärnu Tervis übernahm, und konnte diese für sich entscheiden, nachdem Pärnu keine spielberechtigten Spieler zur Verfügung hatte.
Wegen des Einsatzes in der U-18-Mannschaft konnte Pärnu Tervis nicht auf seine Spieler zurückgreifen und zog zurück. FC Kuressaare damit kampflos Sieger der Relegation.