دینوکوکوس-ترموس - ویکی‌پدیا، دانشنامهٔ آزاد

Deinococcus–Thermus
رده‌بندی علمی
حوزه:	باکتری
شاخه:	Deinococcus–Thermus
رده:	دینوکوکوس-ترموس
Orders & Families
	دینوکوکوس-ترموس دینوکوکوس Trueperaceae ترمال‌ها *Thermaceae;
مترادف
	Deinococcaeota Oren et al. 2015;

دینوکوکوس-ترموس یک شاخه از باکتری‌ها است که بسیار مقاوم به خطرات زیست‌محیطی هستند و همچنین به عنوان شدیددوست‌ها شناخته می‌شوند.^[۱]

این باکتری‌ها دیواره سلولی ضخیمی دارند که آنها را سویه‌های گرم مثبت می‌سازد، اما آنها غشا دومی نیز دارند و بنابراین در ساختار به باکتریهای گرم منفی نزدیکترند.^[۲]^[۳]^[۴] کاوالیر-اسمیت این کلاد را هدوباکتریا خواندند.^[۵] (گرفته شده از هادس، جهان زیرزمینی یونانی).

طبقه‌بندی

شاخهٔ دینوکوکوس-ترموس متشکل از یک ردهٔ (دینوکوکی) و دو راسته است:

دینوکوکال‌ها شامل دو تیره (دینوکوکاسا و تروپراسا) با سه سردهٔ دینوکوکوس، دینوباکتریوم و تروپرا است.^[۶]^[۷]^[۸] تروپرا رادیوویکتریکس اولین عضو متفرقهٔ راسته است. درون راسته، با توجه به گونه‌های دینوباکتریوم و تروپرا، دینوکوکوس یک خوشهٔ گروه فراگیر مجزا است.^[۹] این سرده شامل چندین گونه است که به اشعه مقاوم هستند؛ آنها برای توانایی خود در خوردن زباله‌های هسته‌ای و سایر مواد سمی، زنده ماندن در خلاء و زنده ماندن در سرما و گرمای شدید معروف هستند.
^[۱۰]
ترمال‌ها شامل چندین سردهٔ مقاوم در برابر گرما (مارینیترموس، میوترموس، اوشنیترموس، ترموس، ولکانیترموس، رابدوترموس) قرارگرفته در تیرهٔ می‌باشد.^[۱۱] تجزیه و تحلیل تبارزایی نشان می‌دهد که در ترمال‌ها، با توجه به مارینیترموس، اوشنیترموس، ولکانیترموس و رابدیترموس که به عنوان گروه‌های خارجی درون راسته هستند، گونه‌های میوترموس و ترموس یک گروه فراگیر را تشکیل می‌دهند. . این موضوع پیشنهاد می‌کند که گونه‌های میوترموس و ترموس نسبت به دیگر سرده‌های درون راسته به هم نزدیکتر هستند. ترموس آکواتیکوس در توسعهٔ PCR برای استفاده از آنزیم DNAپلیمراز مقاوم به گرما بسیار مهم بود.^[۱۲]

هر چند این دو گروه از یک جد مشترک تکامل یافته‌اند، دو مکانیسم مقاومت تا حد زیادی مستقل از هم به نظر می‌رسد.^[۱۳]

منابع

↑ Griffiths E, Gupta RS (September 2007). "Identification of signature proteins that are distinctive of the Deinococcus–Thermus phylum" (PDF). Int. Microbiol. 10 (3): 201–8. PMID 18076002. Archived from the original (PDF) on 2011-06-14.
↑ Gupta RS (2011). "Origin of diderm (Gram-negative) bacteria: antibiotic selection pressure rather than endosymbiosis likely led to the evolution of bacterial cells with two membranes". Antonie Van Leeuwenhoek. 100 (2): 171–182. doi:10.1007/s10482-011-9616-8. PMC 3133647. PMID 21717204.
↑ Campbell C, Sutcliffe IC, Gupta RS (2014). "Comparative proteome analysis of Acidaminococcus intestini supports a relationship between outer membrane biogenesis in Negativicutes and Proteobacteria". Arch Microbiol. 196 (4): 307–310. doi:10.1007/s00203-014-0964-4. PMID 24535491.
↑ Sutcliffe IC (2010). "A phylum level perspective on bacterial cell envelope architecture". Trends Microbiol. 18 (10): 464–470. doi:10.1016/j.tim.2010.06.005. PMID 20637628.
↑ Cavalier-Smith T (2006). "Rooting the tree of life by transition analyses". Biol. Direct. 1: 19. doi:10.1186/1745-6150-1-19. PMC 1586193. PMID 16834776. Archived from the original on 18 December 2019. Retrieved 10 July 2017.
↑ Albuquerque L, Simões C, Nobre MF, et al. (2005). "Truepera radiovictrix gen. nov. , sp. nov. , a new radiation resistant species and the proposal of Trueperaceae fam. nov". FEMS Microbiol Lett. 247 (2): 161–169. doi:10.1016/j.femsle.2005.05.002. PMID 15927420.
↑ Garrity GM, Holt JG. (2001) Phylum BIV.
↑ Garrity GM, Bell JA, Lilburn TG. (2005) Phylum BIV.
↑ Ho J, Adeolu M, Khadka B, Gupta RS (2016). "Identification of distinctive molecular traits that are characteristic of the phylum "Deinococcus-Thermus" and distinguish its main constituent groups". Syst Appl Microbiol. 39 (7): 453–463. doi:10.1016/j.syapm.2016.07.003. PMID 27506333.
↑ Battista JR, Earl AM, Park MJ (1999). "Why is Deinococcus radiodurans so resistant to ionizing radiation?". Trends Microbiol. 7 (9): 362–5. doi:10.1016/S0966-842X(99)01566-8. PMID 10470044.
↑ «نسخه آرشیو شده». بایگانی‌شده از اصلی در ۲۷ ژانویه ۲۰۱۳. دریافت‌شده در ۱۰ ژوئیه ۲۰۱۷.
↑ Nelson RM, Long GL (1989). "A general method of site-specific mutagenesis using a modification of the Thermus aquaticus". Anal Biochem. 180 (1): 147–151. doi:10.1016/0003-2697(89)90103-6. PMID 2530914.
↑ "Comparative genomics of Thermus thermophilus and Deinococcus radiodurans: divergent routes of adaptation to thermophily and radiation resistance". BMC Evol. Biol. 5: 57. 2005. doi:10.1186/1471-2148-5-57. PMC 1274311. PMID 16242020.

[pmid_18076002-1] Griffiths E, Gupta RS (September 2007). "Identification of signature proteins that are distinctive of the Deinococcus–Thermus phylum" (PDF). Int. Microbiol. 10 (3): 201–8. PMID 18076002. Archived from the original (PDF) on 2011-06-14.

[pmid_21717204-2] Gupta RS (2011). "Origin of diderm (Gram-negative) bacteria: antibiotic selection pressure rather than endosymbiosis likely led to the evolution of bacterial cells with two membranes". Antonie Van Leeuwenhoek. 100 (2): 171–182. doi:10.1007/s10482-011-9616-8. PMC 3133647. PMID 21717204.

[pmid_24535491-3] Campbell C, Sutcliffe IC, Gupta RS (2014). "Comparative proteome analysis of Acidaminococcus intestini supports a relationship between outer membrane biogenesis in Negativicutes and Proteobacteria". Arch Microbiol. 196 (4): 307–310. doi:10.1007/s00203-014-0964-4. PMID 24535491.

[pmid_20637628-4] Sutcliffe IC (2010). "A phylum level perspective on bacterial cell envelope architecture". Trends Microbiol. 18 (10): 464–470. doi:10.1016/j.tim.2010.06.005. PMID 20637628.

[pmid_16834776-5] Cavalier-Smith T (2006). "Rooting the tree of life by transition analyses". Biol. Direct. 1: 19. doi:10.1186/1745-6150-1-19. PMC 1586193. PMID 16834776. Archived from the original on 18 December 2019. Retrieved 10 July 2017.

[pmid_15927420-6] Albuquerque L, Simões C, Nobre MF, et al. (2005). "Truepera radiovictrix gen. nov. , sp. nov. , a new radiation resistant species and the proposal of Trueperaceae fam. nov". FEMS Microbiol Lett. 247 (2): 161–169. doi:10.1016/j.femsle.2005.05.002. PMID 15927420.

[Garrity1-7] Garrity GM, Holt JG. (2001) Phylum BIV.

[Garrity2-8] Garrity GM, Bell JA, Lilburn TG. (2005) Phylum BIV.

[pmid_27506333-9] Ho J, Adeolu M, Khadka B, Gupta RS (2016). "Identification of distinctive molecular traits that are characteristic of the phylum "Deinococcus-Thermus" and distinguish its main constituent groups". Syst Appl Microbiol. 39 (7): 453–463. doi:10.1016/j.syapm.2016.07.003. PMID 27506333.

[pmid_10470044-10] Battista JR, Earl AM, Park MJ (1999). "Why is Deinococcus radiodurans so resistant to ionizing radiation?". Trends Microbiol. 7 (9): 362–5. doi:10.1016/S0966-842X(99)01566-8. PMID 10470044.

[11] «نسخه آرشیو شده». بایگانی‌شده از اصلی در ۲۷ ژانویه ۲۰۱۳. دریافت‌شده در ۱۰ ژوئیه ۲۰۱۷.

[pmid_2530914-12] Nelson RM, Long GL (1989). "A general method of site-specific mutagenesis using a modification of the Thermus aquaticus". Anal Biochem. 180 (1): 147–151. doi:10.1016/0003-2697(89)90103-6. PMID 2530914.

[pmid_16242020-13] "Comparative genomics of Thermus thermophilus and Deinococcus radiodurans: divergent routes of adaptation to thermophily and radiation resistance". BMC Evol. Biol. 5: 57. 2005. doi:10.1186/1471-2148-5-57. PMC 1274311. PMID 16242020.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]

[۷]

[۸]

[۹]

[۱۰]

[۱۱]

[۱۲]

[۱۳]