وی فارغالتحصیل مهندسی معدن از دانشگاه امیرکبیر تهران است. میرباقری پس از گذراندن یک دوره سه ساله هنرآموزی تئاتر در «تئاتر شهر» در سال ۱۳۵۹ فعالیتش در تئاتر و همزمان در تلویزیون را آغاز کرد. او اولین بار سینما را با نویسندگی و کارگردانی فیلم «آدمبرفی» تجربه کرد. فیلمی که تا مدتها توقیف بود و پس از رفع توقیف اکران شد. از مهمترین سریالهای تلویزیونی وی سریال امام علی است که مربوط به دوران حکومت علی بن ابی طالب است، این سریال محصول سال ۱۳۷۵–۱۳۷۰ است.
حدود ۸ سال از زندگی میرباقری صرف ساخت سریال ماندگار (مختارنامه) شدهاست.
در مرداد ۱۳۹۰ از در اندیشه داشتن ساخت فیلمی با محوریت زندگی سلمان فارسی خبر داد.[۲][۳] میرباقری در سال ۱۳۹۳ نشان افتخار جهادگر عرصه فرهنگ و هنر را دریافت کرد و در سال ۱۳۹۶ استادی افتخاری دانشگاه صدا و سیما به وی اعطا شد. در مراسمی که با تلاش انجمن تجلیل از چهرههای هنری و فرهنگی شاهرود با همکاری سیما فیلم در تالار شقایقهای دانشگاه صنعتی شاهرود با حضور جمعی از هنرمندان و کارگردانان سینما و تلویزیون و فرماندار- شهردار- اعضای شورای شهر و نماینده مردم شاهرود جمله برگزار شد از خدمات میرباقری در زمینه فرهنگ و هنر تجلیل بهعمل آمد.[۴] همچنین بهپاس خدماتش بلواری در شهر بسطام به نام بلوار داوود میرباقری نامگذاری گردید.[۵]