ARID1A - ویکی‌پدیا، دانشنامهٔ آزاد

ARID1A
ساختارهای موجود
PDBجستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگرARID1A, B120, BAF250, BAF250a, BM029, C1orf4, ELD, MRD14, OSA1, P270, SMARCF1, hELD, hOSA1, CSS2, AT-rich interaction domain 1A
شناسه‌های بیرونیOMIM: 603024 MGI: 1935147 HomoloGene: 21216 GeneCards: ARID1A
هم‌ساخت‌شناسی
گونه‌هاانسانموش
Entrez
آنسامبل
یونی‌پروت
RefSeq (mRNA)

NM_006015، NM_018450 NM_139135، NM_006015، NM_018450

XM_006539325، XM_006539326، XM_006539327، NM_001363070، XM_030253943 NM_001080819، XM_006539325، XM_006539326، XM_006539327، NM_001363070، XM_030253943

RefSeq (پروتئین)

NP_624361 NP_006006، NP_624361

XP_006539388، XP_006539389، XP_006539390، NP_001349999، XP_030109803، XP_036020470، XP_036020471، NP_001388200، NP_001388202، NP_001388204، NP_001388205 NP_001074288، XP_006539388، XP_006539389، XP_006539390، NP_001349999، XP_030109803، XP_036020470، XP_036020471، NP_001388200، NP_001388202، NP_001388204، NP_001388205

موقعیت (UCSC)ن/مChr : 133.68 – 133.76 Mb
جستجوی PubMed[۲][۳]
ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسانمشاهده/ویرایش موش

پروتئین اِی۱ حاوی دومِـین تعاملی غنی از آدنین-تیمین (انگلیسی: AT-rich interactive domain-containing protein 1A) یک پروتئین است که در انسان توسط ژن «ARID1A» کُدگذاری می‌شود.[۴][۵][۶]

اهمیت بالینی

[ویرایش]

این پروتئین متعلق به خانوادهٔ SWI/SNF است که همگی خواص هلیکاز و ای‌تی‌پاز دارند و در تنظیم رونویسی برخی ژن‌ها از طریق ایجاد تغییر در ساختارهای کروماتین آنها نقش دارد. جهش در کُدگذاری ژن این پروتئین، شایع‌ترین عضو خانوادهٔ SWI/SNF جهش‌یافته در میان سرطان‌ها است.[۷] این ژن معمولاً در سرطان‌های مختلف جهش‌یافته است که یک «جهش کارکردزُدا» است، از جمله در سرطان معده،[۸] سرطان روده بزرگ،[۹] کارسینوم سلول شفاف تخمدان،[۱۰] سرطان کبد،[۱۱] لنفوم[۱۲] و سرطان لوزالمعده.[۱۳] در متاستازهای دوردست سرطان پستان، جهش‌های غیرفعال‌کننده‌ای در ژن «ARID1A» تجمیع می‌شود که در تومور اولیه دیده نمی‌شوند، و کاهش بیان ژن «ARID1A» باعث مقاومت در برابر داروهای مختلف مانند تراستوزومب و مهارکننده‌های mTOR می‌شود. این یافته‌ها دلیلی برای توضیح این موضوع است که چرا تومورها جهش‌های ژن ARID1A را تجمیع و حفظ می‌کنند.[۱۴][۱۵]

منابع

[ویرایش]
  1. ۱٫۰ ۱٫۱ ۱٫۲ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000007880 - Ensembl, May 2017
  2. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. Takeuchi T, Furihata M, Heng HH, Sonobe H, Ohtsuki Y (June 1998). "Chromosomal mapping and expression of the human B120 gene". Gene. 213 (1–2): 189–193. doi:10.1016/S0378-1119(98)00194-2. PMID 9630625.
  5. Takeuchi T, Chen BK, Qiu Y, Sonobe H, Ohtsuki Y (December 1997). "Molecular cloning and expression of a novel human cDNA containing CAG repeats". Gene. 204 (1–2): 71–77. doi:10.1016/S0378-1119(97)00525-8. PMID 9434167.
  6. "Entrez Gene: ARID1A AT rich interactive domain 1A (SWI-like)".
  7. Gourisankar S, Krokhotin A, Wenderski W, Crabtree GR (November 2023). "Context-specific functions of chromatin remodellers in development and disease". Nature Reviews. Genetics: 1–22. doi:10.1038/s41576-023-00666-x. PMID 38001317.
  8. Wang K, Kan J, Yuen ST, Shi ST, Chu KM, Law S, Chan TL, Kan Z, Chan AS, Tsui WY, Lee SP, Ho SL, Chan AK, Cheng GH, Roberts PC, Rejto PA, Gibson NW, Pocalyko DJ, Mao M, Xu J, Leung SY (October 2011). "Exome sequencing identifies frequent mutation of ARID1A in molecular subtypes of gastric cancer". Nature Genetics. 43 (12): 1219–1223. doi:10.1038/ng.982. PMID 22037554. S2CID 8884065.
  9. Mathur R, Alver BH, San Roman AK, Wilson BG, Wang X, Agoston AT, Park PJ, Shivdasani RA, Roberts CW (February 2017). "ARID1A loss impairs enhancer-mediated gene regulation and drives colon cancer in mice". Nature Genetics. 49 (2): 296–302. doi:10.1038/ng.3744. PMC 5285448. PMID 27941798.
  10. Wiegand KC, Shah SP, Al-Agha OM, Zhao Y, Tse K, Zeng T, Senz J, McConechy MK, Anglesio MS, Kalloger SE, Yang W, Heravi-Moussavi A, Giuliany R, Chow C, Fee J, Zayed A, Prentice L, Melnyk N, Turashvili G, Delaney AD, Madore J, Yip S, McPherson AW, Ha G, Bell L, Fereday S, Tam A, Galletta L, Tonin PN, Provencher D, Miller D, Jones SJ, Moore RA, Morin GB, Oloumi A, Boyd N, Aparicio SA, Shih I, Mes-Masson AM, Bowtell DD, Hirst M, Gilks B, Marra MA, Huntsman DG (October 2010). "ARID1A mutations in endometriosis-associated ovarian carcinomas". The New England Journal of Medicine. 363 (16): 1532–1543. doi:10.1056/NEJMoa1008433. PMC 2976679. PMID 20942669.
  11. Sun X, Wang SC, Wei Y, Luo X, Jia Y, Li L, Gopal P, Zhu M, Nassour I, Chuang JC, Maples T, Celen C, Nguyen LH, Wu L, Fu S, Li W, Hui L, Tian F, Ji Y, Zhang S, Sorouri M, Hwang TH, Letzig L, James L, Wang Z, Yopp AC, Singal AG, Zhu H (November 2017). "Arid1a Has Context-Dependent Oncogenic and Tumor Suppressor Functions in Liver Cancer". Cancer Cell. 32 (5): 574–589.e6. doi:10.1016/j.ccell.2017.10.007. PMC 5728182. PMID 29136504.
  12. Barisic D, Chin CR, Meydan C, Teater M, Tsialta I, Mlynarczyk C, Chadburn A, Wang X, Sarkozy M, Xia M, Carson SE, Raggiri S, Debek S, Pelzer B, Durmaz C, Deng Q, Lakra P, Rivas M, Steidl C, Scott DW, Weng AP, Mason CE, Green MR, Melnick A (March 2024). "ARID1A orchestrates SWI/SNF-mediated sequential binding of transcription factors with ARID1A loss driving pre-memory B cell fate and lymphomagenesis". Cancer Cell. doi:10.1016/j.ccell.2024.02.010. PMID 38458187.
  13. Shain AH, Giacomini CP, Matsukuma K, Karikari CA, Bashyam MD, Hidalgo M, Maitra A, Pollack JR (January 2012). "Convergent structural alterations define SWItch/Sucrose NonFermentable (SWI/SNF) chromatin remodeler as a central tumor suppressive complex in pancreatic cancer". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109 (5): E252–E259. doi:10.1073/pnas.1114817109. PMC 3277150. PMID 22233809.
  14. Berns K, Sonnenblick A, Gennissen A, Brohée S, Hijmans EM, Evers B, Fumagalli D, Desmedt C, Loibl S, Denkert C, Neven P, Guo W, Zhang F, Knijnenburg TA, Bosse T, van der Heijden MS, Hindriksen S, Nijkamp W, Wessels LF, Joensuu H, Mills GB, Beijersbergen RL, Sotiriou C, Bernards R (November 2016). "Loss of ARID1A Activates ANXA1, which Serves as a Predictive Biomarker for Trastuzumab Resistance". Clinical Cancer Research. 22 (21): 5238–5248. doi:10.1158/1078-0432.CCR-15-2996. PMID 27172896.
  15. Yates LR, Knappskog S, Wedge D, Farmery JH, Gonzalez S, Martincorena I, Alexandrov LB, Van Loo P, Haugland HK, Lilleng PK, Gundem G, Gerstung M, Pappaemmanuil E, Gazinska P, Bhosle SG, Jones D, Raine K, Mudie L, Latimer C, Sawyer E, Desmedt C, Sotiriou C, Stratton MR, Sieuwerts AM, Lynch AG, Martens JW, Richardson AL, Tutt A, Lønning PE, Campbell PJ (August 2017). "Genomic Evolution of Breast Cancer Metastasis and Relapse". Cancer Cell. 32 (2): 169–184.e7. doi:10.1016/j.ccell.2017.07.005. PMC 5559645. PMID 28810143.

برای مطالعهٔ بیشتر

[ویرایش]

پیوند به بیرون

[ویرایش]