A Certain Scientific Accelerator

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Ancora in ospedale per riprendersi dalla ferita subita mentre proteggeva Last Order da Amai Ao, Accelerator deve affrontare una squadra di ESPper che fanno irruzione sul luogo con l'intenzione di ucciderlo. Poco dopo uno dei membri ruba un sacchetto che Last Order voleva consegnare al suo amico, e così tutta la squadra di ESPer fugge via ma Accelerator riesce a trovarli e sgominarli, facendosi ridare quanto gli spettava.

L'episodio si apre con Hitokawa Hasami, una ragazza che tenta il suicidio buttandosi giù da un ponte per sfuggire ai numerosi problemi che aveva già riscontrato nella sua giovane vita, tuttavia con sua grande sorpresa si risveglia su una barella all'interno di un furgone dove tre membri dell'Anti-Skill decidono di ucciderla per divertimento ritenendola un fallimento su tutta la linea. Successivamente Esther Rosenthal, una giovane negromante, viene inseguita da altri soldati dell'Anti-Skill mentre fugge all'interno dell'ospedale. Riesce ad accedere alla stanza di Accelerator e tenta di chiedergli aiuto per una questione molto importante ma non fa in tempo in quanto i suoi nemici riescono a colpirla con delle scariche elettriche facendola svenire. I soldati informano il presente di aver catturato una criminale grazie al suo aiuto ma il ragazzo non li degna di nessuna attenzione e persevera a rilassarsi, così gli uomini armati se ne vanno portando via Esther, ma in realtà Accelerator, che non è in grado di sentire nulla senza le sue batterie, si accorge comunque che qualcosa non quadrava. Così sistema il dispositivo che ha al collo e scende nel parcheggio dell'ospedale perché ha notato dei movimenti anomali. Qui trova alcuni membri dell'Anti-Skill che si comportano in modo sospetto quindi decide di attaccarli e scopre che in realtà sono alcuni sicari della DA (Disciplinary Action), ovvero un gruppo di persone che ha a cuore una giustizia corrotta. Quest'ultimi vengono messi con le spalle al muro e si fanno aiutare da un robot molto potente che però non impensierisce Accelerator che lo distrugge abbastanza facilmente, tuttavia rimane inorridito dalla presenza del cadavere di Hasami all'interno della capsula di pilotaggio. A tarda sera, Esther riesce finalmente a parlare con Accelerator e chiedergli il suo aiuto, spiegandogli che una malvagia organizzazione aveva messo gli occhi su Last Order; nonostante il ragazzo sia un po' riluttante, alla fine accetta. di collaborare.

Accelerator fornisce rifugio a Esther mentre indagano ulteriormente sulla DA, ovvero l'organizzazione che vuole usare il potere per il proprio tornaconto. Successivamente il dottor Heaven Canceller informa i due di aver eseguito un'autopsia sul corpo di Hasami, affermando che aveva trovato qualcosa che andava oltre le sue capacità. L'uomo porge un sacchetto di quello che aveva trovato nella bocca della deceduta e poi si reca a svolgere un'altra visita, intanto Esther riconosce che quello che aveva rinvenuto era un talismano spirituale di basso livello e si reca assieme ad Accelerator presso l'obitorio. Una volta arrivati, Esther cerca di far rivivere Hasami inserendo un'anima artificiale chiamata Huotou nel suo corpo, la quale avrebbe potuto aiutarli nelle loro ricerca di informazioni sulla DA. Tuttavia, prima che il processo sia completato, entrano due soldati della DA con l'intenzione di portare via il corpo ma vengono prontamente fermati da Accelerator.

Huotou riesce a risvegliarsi all'interno del corpo di Hasami e aiuta Accelerator a sconfiggere i due nemici. Successivamente la DA decide di rivoltarsi contro l'Alto Consiglio della Città-Studio, che in risposta invia le "Scavengers", una squadra di quattro giovani assassine pronte a sbarazzarsi di loro.

L'Anti-Skill attacca il nascondiglio della DA e la loro battaglia diventa ancora più sanguinosa con l'apparizione delle Scavengers che sembrano inarrestabili.

Dopo la battaglia, le Scavengers attaccano Esther con l'intento di rapire l'unità Misaka che sta proteggendo, fino a quando non arriva Accelerator ad aiutarla. Alla fine questi riesce a sbaragliare tutte e quattro le assassine con estrema facilità ma senza ucciderle.

Subito dopo aver salvato l'unità Misaka dalle Scavengers, questa viene rapita da tre potenti mech che prendono il volo, così Accelerator parte al loro inseguimento. Si scopre presto che i robot vengono controllati da un giovane scienziato di nome Hishigata che vuole usare la ragazza per uno scopo preciso e ben calcolato, ovvero quello di far passare sua sorella Hirumi al tanto agognato livello 6.

La scena si sposta su un lungo flashback ambientato un po' di tempo prima dell'inizio della serie. Hishigata entra in contatto con la negromante Esther per aiutare la sua sorellina Hirumi a raggiungere il fantomatico livello 6. Hirumi e Esther fanno presto amicizia ma il rapporto non dura molto perché la prima ha sempre nascosto le sue reali condizioni di salute al fratello, le quali non sono molto positive. Con il poco tempo rimastogli per vivere, Hirumi decide di suicidarsi in un'enorme vasca con l'intento di aiutare il fratello nel compimento del suo esperimento. Così il suo corpo viene spostato inserito in un particolare macchinario ed Esther cerca di ridare vita alla ragazza trasferendo l'anima artificiale di Taowu al suo interno ma si accorge presto che la sua amica non è più la stessa.

Il piano di Hishigata si avvicina sempre più alla sua realizzazione ma Esther vuole fermarlo a tutti i costi, così carica un pugnale con i propri poteri e cerca di uccidere Hirumi che si sta preparando a passare al livello 6. Tuttavia, poco prima che Esther riesca nel suo intento, Hishigata le si para dinanzi facendo da scudo alla sorella e viene pugnalato al suo posto, permettendo così a Hirumi di completare il suo processo di evoluzione con tutta calma. Il giovane scienziato è gravemente ferito e afferma che nel giro di qualche ora morirà, tuttavia si rivela felice di poter finalmente ammirare la fase finale del suo esperimento. Intanto Accelerator tarda ad arrivare perché è impegnato ad affrontare i tre mech mandati da Hishigata.

Completata la sua installazione, l'essere che si fa chiamare "Hirumi" si risveglia e fa crescere un enorme corpo grottesco che invade velocemente l'intera zona. Così Esther le chiede delle spiegazioni riguardo alle sue azioni, e la falsa "Hirumi" le rivela il vero legame che c'era fra di loro. L'essere che aveva dinanzi aveva l'aspetto della sua amica ma l'anima di Taowu in realtà nascondeva al suo interno quella di un suo antenato chiamato Isaac, il quale fin dai tempi antichi faceva un uso spietato della negromanzia e perciò era noto con il soprannome di "demone". Così Isaac/Hirumi sostiene che un negromante porta la morte ovunque vada e anche Esther non faceva eccezione; con queste parole cerca di far perdere la speranza alla ragazza e poi si prepara a creare il suo corpo perfetto all'esterno del laboratorio, il golem.

Il piano di Isaac, che prevede la creazione di un corpo paragonabile a quello di un dio, sembra quasi completo, ma si accorge che gli manca ancora qualche elemento di cui non è ancora a conoscenza. Nel frattempo Accelerator, Esther e gli altri decidono di fare irruzione nel suo enorme corpo per fermarlo una volta per tutte ma vengono inaspettatamente aiutati da Hishigata, che nonostante sia prossimo alla morte, offre di guidarli verso il nucleo del mostro, in modo da poter finalmente dare pace all'anima di sua sorella. Isaac invece comincia ad uccidere e assorbire i soldati della DA ed alcuni dell'Anti-Skill per potenziarsi, dopodiché invia delle copie zombie delle persone che ha appena sterminato contro Accelerator e i suoi compagni ma i nemici vengono comunque sconfitti.

Il corpo golem di Isaac diventa sempre più forte, nel mentre Accelerator e gli altri si avvicinano sempre di più a lui per tentare di sconfiggerlo definitivamente. Il nemico però sembra perdere parte della sua lucidità mentale a causa dell'influenza delle anime che ha inglobato in precedenza ma in tutti i casi il suo potere rimane comunque devastante. Dopo una furiosa battaglia, il nemico viene progressivamente indebolito sia da Accelerator in combinazione con Hishigata e l'unità Misaka che hanno sabotato il macchinario che teneva originariamente il corpo di Hirumi. Così Esther riesce finalmente ad avvicinarsi ad Isaac e sferra il suo attacco finale con il pugnale magico grazie all'aiuto di Huotou e dell'unità Misaka. L'anima di Isaac viene distrutta e per pochi istanti fa ritorno la vera Hirumi che ringrazia Esther per tutto ciò che aveva fatto per lei, dopodiché si dissolve; pochi istanti dopo il fratello Hishigata segue una sorte simile e si accascia a terra per inalare l'ultimo respiro con un sorriso sulle labbra, felice del fatto che sua sorella abbia finalmente trovato la pace. Nonostante tutte queste peripezie, il corpo di Isaac è rimasto dov'era prima e la cosa non si rivela un bene in quanto ha incanalato una quantità di energia impressionante che verrà rilasciata a breve e che distruggerà tutta la città, perciò Accelerator interviene e compie un ultimo sforzo, spedendo l'energia fuori dalla Terra. Dopo la battaglia, Accelerator è tornato in ospedale per le ferite subite che però non sembrano troppo gravi mentre Esther decide di riprendersi l'anima di Huotou che aveva inserito all'interno di Hitokawa Hasami per consentire al corpo di riposare in pace. La negromante fa poi visita ad Accelerator ringraziandolo per il suo enorme aiuto e poi se ne va altrove affermando che avrebbe trovato la strada laddove splende il sole. Da quegli eventi trascorre un po' di tempo ed Accelerator si trova a sorseggiare del caffè nero su una torre dove viene però attaccato da alcuni droni che vogliono una valigia di enormi dimensioni caduta a poca distanza del ragazzo, così questi distrugge i velivoli e nota però che dall'oggetto è spuntata fuori una ragazza addormentata che rischia di cadere giù dal luogo in cui si trovano. L'episodio si conclude con un cliffhanger dove il protagonista afferma che nella vita non ci si annoia mai.

Episodio parodistico dove Accelerator parla della sua vita di tutti i giorni e del cibo che gli piace in maniera esagerata e ironica.