Nella stagione 2006-2007 l'MVV Maastricht ha disputato l'Eerste Divisie, seconda serie del campionato olandese di calcio, terminando la stagione al tredicesimo posto con 46 punti conquistati in 38 giornate, frutto di 11 vittorie, 13 pareggi e 14 sconfitte. Nella KNVB beker l'MVV Maastricht è sceso in campo dal secondo turno, raggiungendo gli ottavi di finale dove è stato eliminato dall'AZ.