Dopo anni in Eredivisie, nella stagione 2006-07 viene sconfitto nello spareggio per la promozione dal VVV Venlo e viene quindi retrocesso in Eerste Divisie. Nell’Eerste Divisie 2008-2009 vince il playoff contro il De Graafschap e ritorna nella massima divisione del campionato olandese; qui però si rende protagonista in negativo e conclude la stagione con un disastroso ultimo posto (soltanto 15 punti totalizzati). Alla fine della stagione 2012-2013 ritrova una nuova promozione, valida per l’Eredivisie 2013-2014. Anche questa volta, però, durerà solo un anno l’avventura nel campionato, chiudendo al 16º posto con 32 punti fatti. L’anno seguente, in Eerste Divisie, la squadra conclude all’ultimo posto (20º), ma nonostante ciò evita la retrocessione in Topklasse (la terza divisione) in quanto alcuni club si sono rifiutati di iscriversi nel mondo dei professionisti.
Il Waalwijk conclude la stagione 2018-2019 di Eerste Divisie all'ottavo posto, sufficiente per la lunga trafila dei playoff promozione. Pur partendo come una delle sfavorite, il club elimina nel doppio scontro il N.E.C., giunto nono in classifica a pari punti, ribaltando una sconfitta per 2-0 rimediata all’andata con un netto 3-0 al ritorno; dopodiché elimina l’Excelsior, piazzatasi sedicesima in Eredivisie, vincendo per 2-1 sul proprio campo e limitando i danni al ritorno con un sofferto 1-1. Giunto all’ultimo doppio incontro prima della promozione, il club affronta il Go Ahead Eagles, squadra giunta quinta in Eerste Divisie, ma che è stata anche capolista solitaria per buona parte del campionato. Il match di andata, giocato in casa, termina con un teso ed equilibrato 0-0, ma il ritorno avvenuto tre giorni dopo si rivela assai più movimentato: il primo tempo si conclude sul punteggio di 2-0 per il Waalwijk, ma gli avversari reagiscono e dopo venti minuti il risultato è già capovolto sul 3-2; tempo di realizzare il gol del pari che il Go Ahead Eagles passa in vantaggio nuovamente nei pressi del 90º minuto. Nonostante ciò, al 96º minuto Spierings porta il match sul momentaneo 4-4, e Bilate, due minuti più tardi, realizza il gol del definitivo sorpasso dagli undici metri, regalando al club l’ennesima promozione in Eredivisie.
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Leen Looijen (1985–86)
Željko Petrović (1º luglio 2007–30 giugno 2008)
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