Денни (гибрид гоминид) — Википедия

Денни (Denisova 11) — окаменелые останки девушки, жившей около 90 000 лет назад, которой было не менее 13 лет и являвшейся метисом. Её матерью была неандерталка, а отцом — денисовец^[1][2]. Денни была найдена в 2012 году, и это первый случай, когда был обнаружен древний человек, чьи родители принадлежали к двум разным видам людей. Её ДНК позволяет проводить обширные сравнительные генетические исследования между человеческими видами, может сообщить о частоте межвидового размножения гоминидов и его влиянии на эволюцию современных людей.

Первоначальный генетический анализ был проведен палеогенетиками Вивиан Слон и Сванте Паабо из Института эволюционной антропологии Макса Планка в Лейпциге, Германия^[1].

Анализ датировки в 2016 году определил, что этот человек умер около 90 000 лет назад, а характеристики фрагмента кости указывают на возраст не менее 13 лет. Анализ последовательности всего генома (общая митохондриальная и ядерная ДНК) показывает, что она была женщиной, с матерью-неандертальцем и отцом-денисовцем^[1][2]. В то время как предыдущие анализы других древних геномов уже привели к выводу, что денисовцы, неандертальцы и современные люди скрещивались во время ледникового периода в Европе и Азии, эта находка является самым прямым доказательством, что скрещивания древних гоминид давали потомство^[2][3][4].

Другие окаменелости, найденные в этой сибирской пещере, ранее показали, что все три вида (современный человек, неандерталец и денисовец) жили там в разное время и что все три вида человека скрещивались друг с другом^[2][4]. Гены обоих архаичных видов человека сегодня присутствуют у многих людей, что говорит о том, что когда эти группы встречались, они фактически смешивались друг с другом^[2][3]. Неизвестно, было ли спаривание по обоюдному согласию, и было ли всё потомство плодовитым. Некоторые из исследователей считают, что это открытие подтверждает предыдущее представление о том, что неандертальцы и денисовцы, возможно, не подверглись вымиранию, а ассимилировались современными человеческими популяциями^[4].

Денисова пещера

Расположение Денисовой пещеры в Алтайских горах в Сибири

Находка представляет собой один фрагмент кости длиной около 2 см, обнаруженный в 2012 году российскими археологами в Денисовой пещере^[5] в 12-м слое Восточной галереи^[6]. Пещера расположена в Алтайском крае в Сибири^[2][4], в горной местности. В то время происхождение фрагмента кости было неизвестно, и он был сохранён вместе с другими 2000 не определёнными фрагментами кости из пещеры для последующей идентификации^[7]. В 2016 году Саманта Браун, в то время студентка магистратуры Оксфордского университета^[8], разбирая тысячи фрагментов из пещеры, изучала белки в коллагене костей, чтобы выяснить, к какому животному виду относился каждый из них^[7][9][10]. Используя этот метод, она идентифицировала кость как гоминина. Он был датирован примерно 90 000 лет назад, а толщина кости использовалась для определения возраста человека, который составлял не менее 13 лет^[7].

В этот момент фрагмент кости был передан в Институт эволюционной антропологии Макса Планка, который ранее выделил и секвенировал денисовскую ДНК^[9]. Первый анализ, проведенный в Максе Планке, касался её митохондриальной ДНК , а затем ядерной ДНК. Публикация их результатов в 2018 году стала первым прямым свидетельством межвидового скрещивания, и её назвали «знаменательной находкой, которая помогает сформировать наше понимание взаимодействия гоминидов»^[9][11].

По словам популяционного генетика Понтуса Скоглунда из Гарвардской медицинской школы, в настоящее время работающего в Институте Фрэнсиса Крика в Лондоне, «найти в первом поколении человека смешанного происхождения из (групп неандертальцев и денисовцев) совершенно невероятная удача… Это действительно прорыв в науке, благодаря доле везения. Я думаю, что этот случай сразу же войдет в учебники»^[1].

Фрагмент кости, идентифицированный кодом DC1227 (GenBank Accession = KU131206) или как Densiova 11, взят из руки или ноги человека^[9]. До извлечения материала для генетического анализа DC1227 весил 1,68 г (0,059 унции) и имел максимальные размеры 24,7 мм (0,97 дюйма) на 8,39 мм (0,330 дюйма)^[7]. В 2016 году команда из Института эволюционной антропологии Макса Планка в Лейпциге, Германия, затем использовала небольшую часть кости для выделения митохондриальной ДНК , которая оказалась полностью неандертальской, что указывает на то, что она была дочерью женщины-неандерталки^[2].

Впоследствии был проведён анализ ядерного генома. Команда извлекла шесть образцов ДНК и создала десять библиотек полных последовательностей генома со средним покрытием 2,6. Анализ показал, что её отец был денисовцем, но имел некоторые неандертальские корни^[2]. Таким образом, этот геном представляет собой первое прямое свидетельство множественных случаев скрещивания между неандертальцами и денисовцами^[12].

Исследователи определили, что мать девушки была генетически ближе к западноевропейским неандертальцам, чем к более ранним неандертальцам, которые жили в Денисовой пещере, предполагая, что некоторые неандертальцы мигрировали из Западной Европы в Центральную Евразию за десятки тысяч лет до того, как этот вид вымер^[2][9].

Гипотеза межпородного скрещивания, гибридизации, смешанного происхождения людей, обсуждалась с тех пор, как в 19 веке были обнаружены останки неандертальца^[13]. От линейного взгляда на эволюцию человека начали отказываться в 1970-х годах, когда были обнаружены разные виды людей, живших одновременно, что сделало линейную концепцию все более маловероятной. В 21 веке с появлением методов молекулярной биологии и компьютеризации было проведено полногеномное секвенирование генома неандертальца и человека, что подтвердило недавнее смешение между разными видами человека^[14].

В 2010 году были опубликованы данные, основанные на молекулярной биологии, иллюстрирующие чёткие примеры скрещивания между архаичными и современными людьми в период среднего палеолита и раннего верхнего палеолита . Было продемонстрировано, что скрещивание произошло в нескольких независимых событиях, включавших неандертальцев, денисовцев, а также нескольких неопознанных гоминидов. Сегодня примерно 2 % ДНК большинства евразийцев принадлежит неандертальцам со следами денисовского наследия^[2]. Кроме того, 4-6 % генома современных меланезийцев являются денисовским^[9]. Денни представляет собой первый случай, когда был обнаружен древний человек, чьи родители принадлежали к двум отдельным видам людей, что означает гибрид 50/50, что позволяет проводить обширные сравнительные генетические исследования^[1][2].

Хотя рассказы об эволюции человека часто противоречивы, открытие Денни и другие открытия, сделанные с 2010 года, показывают, что эволюцию человека следует рассматривать не как простую линейную или разветвленную прогрессию, а как смесь родственных видов^{[15][16][17][18]}. На самом деле, «недавние геномные исследования показали, что гибридизация между существенно расходящимися линиями является правилом, а не исключением в эволюции человека»^[19]. Кроме того, утверждается, что гибридизация была важной творческой силой в развитии современных людей^[19].

В январе 2019 года ученые сообщили, что несколько типов людей, в том числе денисовцы, неандертальцы и родственные им гибриды, могли населять Денисову пещеру на Алтае на протяжении тысяч лет, но неясно, жили ли они когда-либо в этой пещере совместно^[20].

В феврале 2019 года ученые обнаружили доказательства, основанные на генетических исследованиях с использованием искусственного интеллекта (ИИ), которые указывают на существование в геноме современных людей неизвестного предка человека, а не неандертальца, денисовца или человеческого гибрида (как Денни)^[21][22].