EGFLAM — Вікіпедія

EGFLAM
Ідентифікатори
Символи	EGFLAM, AGRINL, AGRNL, PIKA, EGF like, fibronectin type III and laminin G domains, Smp_128580.1
Зовнішні ІД	OMIM: 617683 MGI: 2146149 HomoloGene: 65044 GeneCards: EGFLAM
Онтологія гена
Молекулярна функція	• glycosaminoglycan binding; • calcium ion binding;
Клітинна компонента	• extracellular region; • базальна мембрана; • міжклітинні контакти; • interstitial matrix; • синапс; • GO:0005578 Позаклітинна матриця;
Біологічний процес	• peptide cross-linking via chondroitin 4-sulfate glycosaminoglycan; • extracellular matrix organization; • positive regulation of cell-substrate adhesion; • animal organ morphogenesis; • гістогенез; • cell migration; • substrate adhesion-dependent cell spreading;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	133584
	268780
	ENSG00000164318
	ENSMUSG00000042961
	Q63HQ2
	Q4VBE4
	NM_182801; NM_001205301; NM_152403; NM_182798; NM_182799
	NM_001289496; NM_001289498; NM_178748
	NP_001192230; NP_689616; NP_877950; NP_877953
	NP_001276425; NP_001276427; NP_848863
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EGFLAM (англ. EGF like, fibronectin type III and laminin G domains) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 017 амінокислот, а молекулярна маса — 111 271^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLIRGVLLR	LLLLASSLGP	GAVSLRAAIR	KPGKVGPPLD	IKLGALNCTA
FSIQWKMPRH	PGSPILGYTV	FYSEVGADKS	LQEQLHSVPL	SRDIPTTEEV
IGDLKPGTEY	RVSIAAYSQA	GKGRLSSPRH	VTTLSQDSCL	PPAAPQQPHV
IVVSDSEVAL	SWKPGASEGS	APIQYYSVEF	IRPDFDKKWT	SIHERIQMDS
MVIKGLDPDT	NYQFAVRAMN	SHGPSPRSWP	SDIIRTLCPE	EAGSGRYGPR
YITDMGAGED	DEGFEDDLDL	DISFEEVKPL	PATKGGNKKF	LVESKKMSIS
NPKTISRLIP	PTSASLPVTT	VAPQPIPIQR	KGKNGVAIMS	RLFDMPCDET
LCSADSFCVN	DYTWGGSRCQ	CTLGKGGESC	SEDIVIQYPQ	FFGHSYVTFE
PLKNSYQAFQ	ITLEFRAEAE	DGLLLYCGEN	EHGRGDFMSL	AIIRRSLQFR
FNCGTGVAII	VSETKIKLGG	WHTVMLYRDG	LNGLLQLNNG	TPVTGQSQGQ
YSKITFRTPL	YLGGAPSAYW	LVRATGTNRG	FQGCVQSLAV	NGRRIDMRPW
PLGKALSGAD	VGECSSGICD	EASCIHGGTC	TAIKADSYIC	LCPLGFKGRH
CEDAFTLTIP	QFRESLRSYA	ATPWPLEPQH	YLSFMEFEIT	FRPDSGDGVL
LYSYDTGSKD	FLSINLAGGH	VEFRFDCGSG	TGVLRSEDPL	TLGNWHELRV
SRTAKNGILQ	VDKQKIVEGM	AEGGFTQIKC	NTDIFIGGVP	NYDDVKKNSG
VLKPFSGSIQ	KIILNDRTIH	VKHDFTSGVN	VENAAHPCVR	APCAHGGSCR
PRKEGYDCDC	PLGFEGLHCQ	KECGNYCLNT	IIEAIEIPQF	IGRSYLTYDN
PDILKRVSGS	RSNVFMRFKT	TAKDGLLLWR	GDSPMRPNSD	FISLGLRDGA
LVFSYNLGSG	VASIMVNGSF	NDGRWHRVKA	VRDGQSGKIT	VDDYGARTGK
SPGMMRQLNI	NGALYVGGMK	EIALHTNRQY	MRGLVGCISH	FTLSTDYHIS
LVEDAVDGKN	INTCGAK

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у клітинних контактах, позаклітинному матриксі, синапсах. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26810 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q63HQ2 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26810 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q63HQ2 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]