NIPBL — Вікіпедія

NIPBL
Ідентифікатори
Символи NIPBL, CDLS, CDLS1, IDN3, IDN3-B, Scc2, cohesin loading factor, NIPBL cohesin loading factor
Зовнішні ІД OMIM: 608667 MGI: 1913976 HomoloGene: 15850 GeneCards: NIPBL
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, Cornelia de Lange syndrome[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_015384
NM_133433
NM_027707
NM_201232
RefSeq (білок)
NP_056199
NP_597677
NP_081983
NP_957684
Локус (UCSC) Хр. 5: 36.88 – 37.07 Mb Хр. 15: 8.32 – 8.47 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NIPBL (англ. NIPBL, cohesin loading factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 804 амінокислот, а молекулярна маса — 316 051[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNGDMPHVPITTLAGIASLTDLLNQLPLPSPLPATTTKSLLFNARIAEEV
NCLLACRDDNLVSQLVHSLNQVSTDHIELKDNLGSDDPEGDIPVLLQAVL
ARSPNVFREKSMQNRYVQSGMMMSQYKLSQNSMHSSPASSNYQQTTISHS
PSSRFVPPQTSSGNRFMPQQNSPVPSPYAPQSPAGYMPYSHPSSYTTHPQ
MQQASVSSPIVAGGLRNIHDNKVSGPLSGNSANHHADNPRHGSSEDYLHM
VHRLSSDDGDSSTMRNAASFPLRSPQPVCSPAGSEGTPKGSRPPLILQSQ
SLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKKQKKMKLGKDEKEQSEKAAMYDIISS
PSKDSTKLTLRLSRVRSSDMDQQEDMISGVENSNVSENDIPFNVQYPGQT
SKTPITPQDINRPLNAAQCLSQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSVAAKQPQT
SVVQNQQQISQQGPIYDEVELDALAEIERIERESAIERERFSKEVQDKDK
PLKKRKQDSYPQEAGGATGGNRPASQETGSTGNGSRPALMVSIDLHQAGR
VDSQASITQDSDSIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDIVGSLKSTPENHPETP
KKKSDPELSKSEMKQSESRLAESKPNENRLVETKSSENKLETKVETQTEE
LKQNESRTTECKQNESTIVEPKQNENRLSDTKPNDNKQNNGRSETTKSRP
ETPKQKGESRPETPKQKSDGHPETPKQKGDGRPETPKQKGESRPETPKQK
NEGRPETPKHRHDNRRDSGKPSTEKKPEVSKHKQDTKSDSPRLKSERAEA
LKQRPDGRSVSESLRRDHDNKQKSDDRGESERHRGDQSRVRRPETLRSSS
RNEHGIKSDSSKTDKLERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDS
NKSRSDKLGFKSPTSKDDKRTEGNKSKVDTNKAHPDNKAEFPSYLLGGRS
GALKNFVIPKIKRDKDGNVTQETKKMEMKGEPKDKVEKIGLVEDLNKGAK
PVVVLQKLSLDDVQKLIKDREDKSRSSLKPIKNKPSKSNKGSIDQSVLKE
LPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVNEKPKYAEISSDEDNDSDEAF
ESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRSSGGGRYRNRS
PSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFK
RFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKA
MGIMDKLSTDKTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLI
MERVTKSADACLTTINIMTSPNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYP
QYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVSSLSEL
LEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVENVSELQLCAIKLVTAVFSRYEKHRQ
LILEEIFTSLARLPTSKRSLRNFRLNSSDMDGEPMYIQMVTALVLQLIQC
VVHLPSSEKDSNAEEDSNKKIDQDVVITNSYETAMRTAQNFLSIFLKKCG
SKQGEEDYRPLFENFVQDLLSTVNKPEWPAAELLLSLLGRLLVHQFSNKS
TEMALRVASLDYLGTVAARLRKDAVTSKMDQGSIERILKQVSGGEDEIQQ
LQKALLDYLDENTETDPSLVFSRKFYIAQWFRDTTLETEKAMKSQKDEES
SEGTHHAKEIETTGQIMHRAENRKKFLRSIIKTTPSQFSTLKMNSDTVDY
DDACLIVRYLASMRPFAQSFDIYLTQILRVLGENAIAVRTKAMKCLSEVV
AVDPSILARLDMQRGVHGRLMDNSTSVREAAVELLGRFVLCRPQLAEQYY
DMLIERILDTGISVRKRVIKILRDICIEQPTFPKITEMCVKMIRRVNDEE
GIKKLVNETFQKLWFTPTPHNDKEAMTRKILNITDVVAACRDTGYDWFEQ
LLQNLLKSEEDSSYKPVKKACTQLVDNLVEHILKYEESLADSDNKGVNSG
RLVACITTLFLFSKIRPQLMVKHAMTMQPYLTTKCSTQNDFMVICNVAKI
LELVVPLMEHPSETFLATIEEDLMKLIIKYGMTVVQHCVSCLGAVVNKVT
QNFKFVWACFNRYYGAISKLKSQHQEDPNNTSLLTNKPALLRSLFTVGAL
CRHFDFDLEDFKGNSKVNIKDKVLELLMYFTKHSDEEVQTKAIIGLGFAF
IQHPSLMFEQEVKNLYNNILSDKNSSVNLKIQVLKNLQTYLQEEDTRMQQ
ADRDWKKVAKQEDLKEMGDVSSGMSSSIMQLYLKQVLEAFFHTQSSVRHF
ALNVIALTLNQGLIHPVQCVPYLIAMGTDPEPAMRNKADQQLVEIDKKYA
GFIHMKAVAGMKMSYQVQQAINTCLKDPVRGFRQDESSSALCSHLYSMIR
GNRQHRRAFLISLLNLFDDTAKTDVTMLLYIADNLACFPYQTQEEPLFIM
HHIDITLSVSGSNLLQSFKESMVKDKRKERKSSPSKENESSDSEEEVSRP
RKSRKRVDSDSDSDSEDDINSVMKCLPENSAPLIEFANVSQGILLLLMLK
QHLKNLCGFSDSKIQKYSPSESAKVYDKAINRKTGVHFHPKQTLDFLRSD
MANSKITEEVKRSIVKQYLDFKLLMEHLDPDEEEEEGEVSASTNARNKAI
TSLLGGGSPKNNTAAETEDDESDGEDRGGGTSGSLRRSKRNSDSTELAAQ
MNESVDVMDVIAICCPKYKDRPQIARVVQKTSSGFSVQWMAGSYSGSWTE
AKRRDGRKLVPWVDTIKESDIIYKKIALTSANKLTNKVVQTLRSLYAAKD
GTSS

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Tonkin E.T., Wang T.-J., Lisgo S., Bamshad M.J., Strachan T. (2004). NIPBL, encoding a homolog of fungal Scc2-type sister chromatid cohesion proteins and fly Nipped-B, is mutated in Cornelia de Lange syndrome. Nat. Genet. 36: 636—641. PMID 15146185 DOI:10.1038/ng1363
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Lechner M.S., Schultz D.C., Negorev D., Maul G.G., Rauscher F.J. III (2005). The mammalian heterochromatin protein 1 binds diverse nuclear proteins through a common motif that targets the chromoshadow domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 331: 929—937. PMID 15882967 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.04.016
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
  • Mei L., Liang D., Huang Y., Pan Q., Wu L. (2015). Two novel NIPBL gene mutations in Chinese patients with Cornelia de Lange syndrome. Gene. 555: 476—480. PMID 25447906 DOI:10.1016/j.gene.2014.11.033
  • Park H.D., Ki C.S., Kim J.W., Kim W.T., Kim J.K. (2010). Clinical and genetic analysis of Korean patients with Cornelia de Lange syndrome: two novel NIPBL mutations. Ann. Clin. Lab. Sci. 40: 20—25. PMID 20124326

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з NIPBL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28862 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, Q6KC79 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]