S100B — Вікіпедія

S100B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1MQ1, 1UWO, 2H61, 2M49, 2PRU, 3CZT, 3D0Y, 3D10, 3HCM, 4XYN, 5CSJ, 5CSF, 5CSN, 5CSI
Ідентифікатори
Символи	S100B, NEF, S100, S100-B, S100beta, S100 calcium binding protein B
Зовнішні ІД	OMIM: 176990 MGI: 98217 HomoloGene: 4567 GeneCards: S100B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • S100 protein binding; • protein homodimerization activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • calcium-dependent protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • tau protein binding; • signaling receptor binding; • RAGE receptor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ruffle; • extracellular region; • soma; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• аксоноґенеза; • response to glucocorticoid; • пам'ять; • negative regulation of skeletal muscle cell differentiation; • central nervous system development; • astrocyte differentiation; • positive regulation of synaptic transmission; • positive regulation of cell population proliferation; • regulation of cell shape; • positive regulation of apoptotic process; • learning or memory; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • regulation of neuronal synaptic plasticity; • response to methylmercury; • проліферація; • вроджений імунітет; • cellular response to hypoxia; • довготривала потенціація; • positive regulation of myelination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6285
	20203
	ENSG00000160307
	ENSMUSG00000033208
	P04271
	P50114
	NM_006272
	NM_009115
	NP_006263
	NP_033141
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

S100B (англ. S100 calcium binding protein B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 92 амінокислот, а молекулярна маса — 10 713^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSELEKAMVA		LIDVFHQYSG		REGDKHKLKK		SELKELINNE		LSHFLEEIKE
QEVVDKVMET		LDNDGDGECD		FQEFMAFVAM		VTTACHEFFE		HE

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 
 Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jensen R., Marshak D.R., Anderson C., Lukas T.J., Watterson D.M. (1985). Characterization of human brain S100 protein fraction: amino acid sequence of S100 beta. J. Neurochem. 45: 700—705. PMID 4031854 DOI:10.1111/j.1471-4159.1985.tb04048.x
Baudier J., Glasser N., Haglid K., Gerard D. (1984). Purification, characterization and ion binding properties of human brain S100b protein. Biochim. Biophys. Acta. 790: 164—173. PMID 6487634 DOI:10.1016/0167-4838(84)90220-6
Yang Q., O'Hanlon D., Heizmann C.W., Marks A. (1999). Demonstration of heterodimer formation between S100B and S100A6 in the yeast two-hybrid system and human melanoma. Exp. Cell Res. 246: 501—509. PMID 9925766 DOI:10.1006/excr.1998.4314
Park H., Adsit F.G., Boyington J.C. (2010). The 1.5 A crystal structure of human receptor for advanced glycation endproducts (RAGE) ectodomains reveals unique features determining ligand binding. J. Biol. Chem. 285: 40762—40770. PMID 20943659 DOI:10.1074/jbc.M110.169276
Smith S.P., Shaw G.S. (1998). A novel calcium-sensitive switch revealed by the structure of human S100B in the calcium-bound form. Structure. 6: 211—222. PMID 9519411 DOI:10.1016/S0969-2126(98)00022-7

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10500 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P04271 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10500 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P04271 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]