TRIM21 — Вікіпедія

TRIM21
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TRIM21, RNF81, RO52, Ro/SSA, SSA, SSA1, tripartite motif containing 21, Tripartite motif-containing protein 21
Зовнішні ІД OMIM: 109092 MGI: 106657 HomoloGene: 2365 GeneCards: TRIM21
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_003141
NM_001082552
NM_009277
RefSeq (білок)
NP_003132
н/д
Локус (UCSC) Хр. 11: 4.38 – 4.39 Mb Хр. 7: 102.21 – 102.21 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TRIM21 (англ. Tripartite motif containing 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 475 амінокислот, а молекулярна маса — 54 170[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKGGGSV
CPVCRQRFLLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLH
LFCEKDGKALCWVCAQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQ
ELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQKSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQEL
EKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDRRCHSSALELLQEVIIV
LERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLDPDTANPWL
ILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTG
KEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLHL
QVPPCQVGIFLDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGF
NDGGKNTAPLTLCPLNIGSQGSTDY

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, цитоплазматичних везикулах.

Література

[ред. | ред. код]
  • Itoh K., Itoh Y., Frank M.B. (1991). Protein heterogeneity in the human Ro/SSA ribonucleoproteins. The 52- and 60-kD Ro/SSA autoantigens are encoded by separate genes. J. Clin. Invest. 87: 177—186. PMID 1985094 DOI:10.1172/JCI114968
  • Chan E.K., Hamel J.C., Buyon J.P., Tan E.M. (1991). Molecular definition and sequence motifs of the 52-kD component of human SS-A/Ro autoantigen. J. Clin. Invest. 87: 68—76. PMID 1985112 DOI:10.1172/JCI115003
  • Tsugu H., Horowitz R., Gibson N., Frank M.B. (1994). The location of a disease-associated polymorphism and genomic structure of the human 52-kDa Ro/SSA locus (SSA1). Genomics. 24: 541—548. PMID 7713506 DOI:10.1006/geno.1994.1664
  • Keech C.L., Gordon T.P., McCluskey J. (1996). Structural differences between the human and mouse 52-kD Ro autoantigens associated with poorly conserved autoantibody activity across species. Clin. Exp. Immunol. 104: 255—263. PMID 8625517 DOI:10.1046/j.1365-2249.1996.16726.x
  • Bepler G., O'Briant K.C., Kim Y.-C., Schreiber G., Pitterle D.M. (1999). A 1.4-Mb high-resolution physical map and contig of chromosome segment 11p15.5 and genes in the LOH11A metastasis suppressor region. Genomics. 55: 164—175. PMID 9933563 DOI:10.1006/geno.1998.5659
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11312 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, P19474 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]