ساختار اولیه پروتئین - ویکی‌پدیا، دانشنامهٔ آزاد

ساختار اولیه پروتئینساختار دوم پروتئینProtein tertiary structureساختار چهارم پروتئین
تصویر بالا حاوی پیوندهایی است که می‌شود روی آن‌ها کلیک کرد
تصویر بالا حاوی پیوندهایی است که می‌شود روی آن‌ها کلیک کرد
نمایش ساختار پروتئین، که در آن از پروتئین PCNA به عنوان نمونه استفاده شده‌است. (پی‌دی‌بی 1AXC)

ساختار اول پروتئین (به انگلیسی: Protein primary structure) عبارت از آرایش و توالی خطی آمینواسیدها در یک پروتئین یا پپتید است که از سر آمینی (N) تا کربوکسیلیک اسید انتهایی (C) ادامه دارد.[۱] در ساختار اولیهٔ پروتئین، فقط شاهد پیوند پپتیدی و ترتیب قرارگیری آمینواسیدها هستیم. بیوسنتز پروتئین در سلول‌ها معمولاً توسط ریبوزوم انجام می‌گیرد اما تولید پپتیدها در آزمایشگاه نیز امکان‌پذیر است.[۲]

توالی‌یابی آمینواسیدها در یک رشته پروتئین، هم به‌طور مستقیم و هم از طریق بررسی رشته دی‌ان‌ای ابتدایی قابل انجام است.[۲]

نمادها و خلاصه‌نویسی

[ویرایش]

توالی‌های آمینو اسیدی معمولاً به‌صورت یک رشته از نمادهای سه‌حرفی یا تک‌حرفی نوشته شده در کنار هم، توصیف می‌شوند.[۳]

نماد اختصاری ۲۰ آمینو اسید طبیعی
آمینو اسید نماد سه‌حرفی نماد یک‌حرفی
Alanine (آلانین) Ala A
Arginine (آرژینین) Arg R
Asparagine (آسپاراژین) Asn N
Aspartic acid

(اسید آسپارتیک)

Asp D
Cysteine (سیستئین) Cys C
Glutamic acid (گلوتامیک اسید) Glu E
Glutamine (گلوتامین) Gln Q
Glycine (گلایسین) Gly G
Histidine (هیستیدین) His H
Isoleucine (ایزولوسین) Ile I
Leucine (لوسین) Leu L
Lysine (لیزین) Lys K
Methionine (متیونین) Met M
Phenylalanine

(فنیل‌آلانین)

Phe F
Proline (پرولین) Pro P
Serine (سرین) Ser S
Threonine (ترئونین) Thr T
Tryptophan (تریپتوفان) Trp W
Tyrosine (تیروزین) Tyr Y
Valine (والین) Val V

منابع

[ویرایش]
  1. Sanger, F. (1952). "The arrangement of amino acids in proteins". Advances in Protein Chemistry. 7: 1–67. doi:10.1016/s0065-3233(08)60017-0. ISSN 0065-3233. PMID 14933251.
  2. ۲٫۰ ۲٫۱ Aasland, Rein; Abrams, Charles; Ampe, Christophe; Ball, Linda J.; Bedford, Mark T.; Cesareni, Gianni; Gimona, Mario; Hurley, James H.; Jarchau, Thomas (2002-02-20). "Normalization of nomenclature for peptide motifs as ligands of modular protein domains". FEBS letters. 513 (1): 141–144. doi:10.1016/s0014-5793(01)03295-1. ISSN 0014-5793. PMID 11911894.
  3. Aasland, Rein; Abrams, Charles; Ampe, Christophe; Ball, Linda J.; Bedford, Mark T.; Cesareni, Gianni; Gimona, Mario; Hurley, James H.; Jarchau, Thomas (2002-02-20). "Normalization of nomenclature for peptide motifs as ligands of modular protein domains". FEBS letters. 513 (1): 141–144. doi:10.1016/s0014-5793(01)03295-1. ISSN 0014-5793. PMID 11911894.