W 1968 wstąpił do Monasteru Trojańskiego jako posłusznik. Równocześnie rozpoczął naukę w sofijskim seminarium duchownym, które ukończył w 1975. 3 marca 1974 złożył w Monasterze Trojańskim wieczyste śluby mnisze przed metropolitą łoweckimGrzegorzem. 15 kwietnia 1974 został wyświęcony na hierodiakona, natomiast 13 kwietnia 1975 został hieromnichem. W tym samym roku rozpoczął wyższe studia teologiczne na Akademii Duchownej św. Klemensa z Ochrydy w Sofii. Od 1976 do 1980 kontynuował edukację na uniwersytecie w Atenach. Po jej ukończeniu w 1980 otrzymał godność archimandryty. W 1986 wyjechał do Ratyzbony na dalsze kształcenie teologiczne. Od 1986 do 1988 był proboszczem parafii św. Jana Rylskiego w Londynie[2].
W styczniu 2012 komisja badająca archiwa tajnych służb komunistycznej Bułgarii podała, że Nataniel (Kałajdżiew) był tajnym współpracownikiem KDS o pseudonimie Błagojew[4].
Zmarł na raka płuc po kilkuletniej chorobie[1]. Został pochowany w cerkwi Zaśnięcia Matki Bożej we wsi Goce Dełczew[5].
↑W służbie Bogu i ludziom. Księga Jubileuszowa Metropolity Warszawskiego i całej Polski Sawy, Warszawska Metropolia Prawosławna, Warszawa 2008, ISBN 978-83-60311-14-1, s.47