SIP1 — Википедия

SIP1
SIP1
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2LEH, 3S6N
Идентификаторы
Псевдонимы	GEMIN2, SIP1, SIP1-delta, Survival of motor neuron protein-interacting protein 1, gem nuclear organelle associated protein 2
Внешние ID	OMIM: 602595 MGI: 1913853 HomoloGene: 37827 GeneCards: GEMIN2
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	14-я хромосома человека
Конец	39,136,973 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	12-я хромосома мыши
Конец	59,075,256 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	buccal mucosa cell; ; secondary oocyte; ; ventricular zone; ; right testis; ; left testis;
	Наибольшая экспрессия в
	otic placode; ; endocardial cushion; ; primitive streak; ; otic vesicle;
	Дополнительные справочные данные
	; ; ; ;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание с белками плазмы;
Компонент клетки	SMN complex; SMN-Sm protein complex; цитозоль; spliceosomal complex; ядрышко; внутренний компонент клетки; клеточное ядро; нуклеоплазма; цитоплазма; ядерные тельца; gemini of coiled bodies;
Биологический процесс	RNA splicing, via transesterification reactions; mRNA processing; spliceosomal complex assembly; Сплайсинг; spliceosomal snRNP assembly; import into nucleus;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	8487
	66603
	ENSG00000092208
	ENSMUSG00000060121
	O14893
	Q9CQQ4
	NM_001009182; NM_001009183; NM_003616
	NM_025656
	NP_001009182; NP_001009183; NP_003607
	NP_079932
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Белок связанный с белком выживания моторных нейронов 1 (англ. Survival of motor neuron protein-interacting protein 1) — белок, который у людей кодируется геном SIP1^[5]^[6]^[7].

Взаимодействия

Как было показано белок SIP1 взаимодействует с DDX20^[8]^[9] и SMN1^[6]^[10]^[11].

Примечания

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000092208 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000060121 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Fischer U., Liu Q., Dreyfuss G. The SMN-SIP1 complex has an essential role in spliceosomal snRNP biogenesis (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — October (vol. 90, no. 6). — P. 1023—1029. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80368-2. — PMID 9323130.
↑ ¹ ² Liu Q., Fischer U., Wang F., Dreyfuss G. The spinal muscular atrophy disease gene product, SMN, and its associated protein SIP1 are in a complex with spliceosomal snRNP proteins (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — October (vol. 90, no. 6). — P. 1013—1021. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80367-0. — PMID 9323129.
↑ Entrez Gene: SIP1 survival of motor neuron protein interacting protein 1 (неопр.).
↑ Mourelatos, Zissimos; Dostie Josée; Paushkin Sergey; Sharma Anup; Charroux Bernard; Abel Linda; Rappsilber Juri; Mann Matthias; Dreyfuss Gideon. miRNPs: a novel class of ribonucleoproteins containing numerous microRNAs (англ.) // Genes Dev. : journal. — United States, 2002. — March (vol. 16, no. 6). — P. 720—728. — ISSN 0890-9369. — doi:10.1101/gad.974702. — PMID 11914277. — PMC 155365.
↑ Charroux B Pellizzoni L Perkinson R A Shevchenko A Mann M Dreyfuss G. Gemin3: A Novel Dead Box Protein That Interacts with Smn, the Spinal Muscular Atrophy Gene Product, and Is a Component of Gems (англ.) // J. Cell Biol.^[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1999. — December (vol. 147, no. 6). — P. 1181—1194. — ISSN 0021-9525. — doi:10.1083/jcb.147.6.1181. — PMID 10601333. — PMC 2168095.
↑ Carnegie Graeme K Sleeman Judith E Morrice Nick Hastie C James Peggie Mark W Philp Amanda Lamond Angus I Cohen Patricia T W. Protein phosphatase 4 interacts with the Survival of motor neurons complex and enhances the temporal localisation of snRNPs (англ.) // Journal of Cell Science^[англ.] : journal. — England: The Company of Biologists^[англ.], 2003. — May (vol. 116, no. Pt 10). — P. 1905—1913. — ISSN 0021-9533. — doi:10.1242/jcs.00409. — PMID 12668731.
↑ Meister, G; Bühler D Laggerbauer B Zobawa M Lottspeich F Fischer U. Characterization of a nuclear 20S complex containing the survival of motor neurons (SMN) protein and a specific subset of spliceosomal Sm proteins (англ.) // Human Molecular Genetics^[англ.] : journal. — ENGLAND: Oxford University Press, 2000. — August (vol. 9, no. 13). — P. 1977—1986. — ISSN 0964-6906. — doi:10.1093/hmg/9.13.1977. — PMID 10942426.

[refGRCh38EnsemblENSG00000092208-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000092208 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000060121-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000060121 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9323130-5] Fischer U., Liu Q., Dreyfuss G. The SMN-SIP1 complex has an essential role in spliceosomal snRNP biogenesis (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — October (vol. 90, no. 6). — P. 1023—1029. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80368-2. — PMID 9323130.

[pmid9323129-6] ¹ ² Liu Q., Fischer U., Wang F., Dreyfuss G. The spinal muscular atrophy disease gene product, SMN, and its associated protein SIP1 are in a complex with spliceosomal snRNP proteins (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — October (vol. 90, no. 6). — P. 1013—1021. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80367-0. — PMID 9323129.

[entrez-7] Entrez Gene: SIP1 survival of motor neuron protein interacting protein 1 (неопр.).

[pmid11914277-8] Mourelatos, Zissimos; Dostie Josée; Paushkin Sergey; Sharma Anup; Charroux Bernard; Abel Linda; Rappsilber Juri; Mann Matthias; Dreyfuss Gideon. miRNPs: a novel class of ribonucleoproteins containing numerous microRNAs (англ.) // Genes Dev. : journal. — United States, 2002. — March (vol. 16, no. 6). — P. 720—728. — ISSN 0890-9369. — doi:10.1101/gad.974702. — PMID 11914277. — PMC 155365.

[pmid10601333-9] Charroux B Pellizzoni L Perkinson R A Shevchenko A Mann M Dreyfuss G. Gemin3: A Novel Dead Box Protein That Interacts with Smn, the Spinal Muscular Atrophy Gene Product, and Is a Component of Gems (англ.) // J. Cell Biol.^[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1999. — December (vol. 147, no. 6). — P. 1181—1194. — ISSN 0021-9525. — doi:10.1083/jcb.147.6.1181. — PMID 10601333. — PMC 2168095.

[pmid12668731-10] Carnegie Graeme K Sleeman Judith E Morrice Nick Hastie C James Peggie Mark W Philp Amanda Lamond Angus I Cohen Patricia T W. Protein phosphatase 4 interacts with the Survival of motor neurons complex and enhances the temporal localisation of snRNPs (англ.) // Journal of Cell Science^[англ.] : journal. — England: The Company of Biologists^[англ.], 2003. — May (vol. 116, no. Pt 10). — P. 1905—1913. — ISSN 0021-9533. — doi:10.1242/jcs.00409. — PMID 12668731.

[pmid10942426-11] Meister, G; Bühler D Laggerbauer B Zobawa M Lottspeich F Fischer U. Characterization of a nuclear 20S complex containing the survival of motor neurons (SMN) protein and a specific subset of spliceosomal Sm proteins (англ.) // Human Molecular Genetics^[англ.] : journal. — ENGLAND: Oxford University Press, 2000. — August (vol. 9, no. 13). — P. 1977—1986. — ISSN 0964-6906. — doi:10.1093/hmg/9.13.1977. — PMID 10942426.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]