COL4A1 — Вікіпедія
COL4A1 (англ. Collagen type IV alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 669 амінокислот, а молекулярна маса — 160 615[6].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGPRLSVWLL | LLPAALLLHE | EHSRAAAKGG | CAGSGCGKCD | CHGVKGQKGE | ||||
RGLPGLQGVI | GFPGMQGPEG | PQGPPGQKGD | TGEPGLPGTK | GTRGPPGASG | ||||
YPGNPGLPGI | PGQDGPPGPP | GIPGCNGTKG | ERGPLGPPGL | PGFAGNPGPP | ||||
GLPGMKGDPG | EILGHVPGML | LKGERGFPGI | PGTPGPPGLP | GLQGPVGPPG | ||||
FTGPPGPPGP | PGPPGEKGQM | GLSFQGPKGD | KGDQGVSGPP | GVPGQAQVQE | ||||
KGDFATKGEK | GQKGEPGFQG | MPGVGEKGEP | GKPGPRGKPG | KDGDKGEKGS | ||||
PGFPGEPGYP | GLIGRQGPQG | EKGEAGPPGP | PGIVIGTGPL | GEKGERGYPG | ||||
TPGPRGEPGP | KGFPGLPGQP | GPPGLPVPGQ | AGAPGFPGER | GEKGDRGFPG | ||||
TSLPGPSGRD | GLPGPPGSPG | PPGQPGYTNG | IVECQPGPPG | DQGPPGIPGQ | ||||
PGFIGEIGEK | GQKGESCLIC | DIDGYRGPPG | PQGPPGEIGF | PGQPGAKGDR | ||||
GLPGRDGVAG | VPGPQGTPGL | IGQPGAKGEP | GEFYFDLRLK | GDKGDPGFPG | ||||
QPGMTGRAGS | PGRDGHPGLP | GPKGSPGSVG | LKGERGPPGG | VGFPGSRGDT | ||||
GPPGPPGYGP | AGPIGDKGQA | GFPGGPGSPG | LPGPKGEPGK | IVPLPGPPGA | ||||
EGLPGSPGFP | GPQGDRGFPG | TPGRPGLPGE | KGAVGQPGIG | FPGPPGPKGV | ||||
DGLPGDMGPP | GTPGRPGFNG | LPGNPGVQGQ | KGEPGVGLPG | LKGLPGLPGI | ||||
PGTPGEKGSI | GVPGVPGEHG | AIGPPGLQGI | RGEPGPPGLP | GSVGSPGVPG | ||||
IGPPGARGPP | GGQGPPGLSG | PPGIKGEKGF | PGFPGLDMPG | PKGDKGAQGL | ||||
PGITGQSGLP | GLPGQQGAPG | IPGFPGSKGE | MGVMGTPGQP | GSPGPVGAPG | ||||
LPGEKGDHGF | PGSSGPRGDP | GLKGDKGDVG | LPGKPGSMDK | VDMGSMKGQK | ||||
GDQGEKGQIG | PIGEKGSRGD | PGTPGVPGKD | GQAGQPGQPG | PKGDPGISGT | ||||
PGAPGLPGPK | GSVGGMGLPG | TPGEKGVPGI | PGPQGSPGLP | GDKGAKGEKG | ||||
QAGPPGIGIP | GLRGEKGDQG | IAGFPGSPGE | KGEKGSIGIP | GMPGSPGLKG | ||||
SPGSVGYPGS | PGLPGEKGDK | GLPGLDGIPG | VKGEAGLPGT | PGPTGPAGQK | ||||
GEPGSDGIPG | SAGEKGEPGL | PGRGFPGFPG | AKGDKGSKGE | VGFPGLAGSP | ||||
GIPGSKGEQG | FMGPPGPQGQ | PGLPGSPGHA | TEGPKGDRGP | QGQPGLPGLP | ||||
GPMGPPGLPG | IDGVKGDKGN | PGWPGAPGVP | GPKGDPGFQG | MPGIGGSPGI | ||||
TGSKGDMGPP | GVPGFQGPKG | LPGLQGIKGD | QGDQGVPGAK | GLPGPPGPPG | ||||
PYDIIKGEPG | LPGPEGPPGL | KGLQGLPGPK | GQQGVTGLVG | IPGPPGIPGF | ||||
DGAPGQKGEM | GPAGPTGPRG | FPGPPGPDGL | PGSMGPPGTP | SVDHGFLVTR | ||||
HSQTIDDPQC | PSGTKILYHG | YSLLYVQGNE | RAHGQDLGTA | GSCLRKFSTM | ||||
PFLFCNINNV | CNFASRNDYS | YWLSTPEPMP | MSMAPITGEN | IRPFISRCAV | ||||
CEAPAMVMAV | HSQTIQIPPC | PSGWSSLWIG | YSFVMHTSAG | AEGSGQALAS | ||||
PGSCLEEFRS | APFIECHGRG | TCNYYANAYS | FWLATIERSE | MFKKPTPSTL | ||||
KAGELRTHVS | RCQVCMRRT |
Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Glanville R.W., Qian R.Q., Siebold B., Risteli J., Kuehn K. (1985). Amino acid sequence of the N-terminal aggregation and cross-linking region (7S domain) of the alpha 1 (IV) chain of human basement membrane collagen. Eur. J. Biochem. 152: 213—219. PMID 4043082 DOI:10.1111/j.1432-1033.1985.tb09186.x
- Soininen R., Haka-Risku T., Prockop D.J., Tryggvason K. (1987). Complete primary structure of the alpha 1-chain of human basement membrane (type IV) collagen. FEBS Lett. 225: 188—194. PMID 3691802 DOI:10.1016/0014-5793(87)81155-9
- Babel W., Glanville R.W. (1984). Structure of human-basement-membrane (type IV) collagen. Complete amino-acid sequence of a 914-residue-long pepsin fragment from the alpha 1(IV) chain. Eur. J. Biochem. 143: 545—556. PMID 6434307 DOI:10.1111/j.1432-1033.1984.tb08404.x
- Siebold B., Deutzmann R., Kuehn K. (1988). The arrangement of intra- and intermolecular disulfide bonds in the carboxyterminal, non-collagenous aggregation and cross-linking domain of basement-membrane type IV collagen. Eur. J. Biochem. 176: 617—624. PMID 2844531 DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14321.x
- Soininen R., Huotari M., Ganguly A., Prockop D.J., Tryggvason K. (1989). Structural organization of the gene for the alpha 1 chain of human type IV collagen. J. Biol. Chem. 264: 13565—13571. PMID 2701944
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL4A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL4A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2202 (англ.) . Архів оригіналу за 23 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P02462 (англ.) . Архів оригіналу за 2 червня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |