Nella stagione 2007-2008 la Pro Sesto ha disputato il girone A del campionato di Serie C1, ottenendo l'undicesimo posto in classifica con 43 punti. Il torneo è stato vinto con 63 punti dal Sassuolo che ha ottenuto la promozione diretta in Serie B, la seconda promossa è stata il Cittadella che ha vinto i Play-off. Per la Pro Sesto si è trattato di un campionato migliore di quanto possa far pensare un undicesimo posto, avendo ottenuto cinque vittorie in trasferta, la più prestigiosa contro il Cittadella, poi promosso in Serie B. Miglior marcatore stagionale il toscano Riccardo Musetti, preso in prestito dal Treviso, ma che ha giocato la scorsa stagione a Massa, autore di 11 reti in campionato. Questa stagione sarà però ricordata a Sesto San Giovanni per lo storico successo ottenuto della squadra Beretti, i ragazzi di Gianluca Andrissi che si sono laureati Campioni d'Italia della loro categoria, si tratta del più importante successo nella storia della Pro Sesto a livello giovanile. Nella Coppa Italia di Serie C la Pro Sesto ha disputato il girone C di qualificazione, che ha promosso il Pavia, ottenendo una sola vittoria a Monza.
^Giornata spostata al 12 dicembre, a seguito della morte del giovane tifoso laziale Gabriele Sandri, dopo una rissa avvenuta in un autogrill l'11 novembre scorso, tra tifosi laziali e juventini.