La stagione 2016-2017 è la ventesima, disputata dal Manchester City, in Premier League e l'ottantottesima nella massima serie del calcio inglese. Come nuovo allenatore, al posto di Manuel Pellegrini viene scelto il pluridecorato Pep Guardiola, reduce dall'esperienza al Bayern Monaco, ingaggiato dal club inglese agli inizi di febbraio, ma in carica solo da giugno[1]. Parallelamente ad un gran sfoltimento di rosa, lo spagnolo riesce a guidare anche importanti operazioni di mercato, quali gli acquisti a titolo definitivo del turco Gündoğan[2] dal Borussia Dortmund, lo spagnolo Nolito[3] dal Celta Vigo, il cileno Bravo dal Barcellona, l'inglese Stones dall'Everton, il tedesco Sané dallo Schalke 04 e il brasiliano Gabriel Jesus dal Palmeiras (squadra in cui quest'ultimo rimarrà in prestito fino a gennaio 2017 per poi approdare ai Citizens durante la sessione di mercato invernale).
La stagione di Premier League inizia nel migliore dei modi per il team di Guardiola, che ottiene una striscia di sei vittorie consecutive iniziali, mantenendo saldamente la prima posizione fino alla decima giornata, nonostante una sconfitta e due pareggi. Prima il Chelsea di Conte[4], poi il Leicester City[5] di Ranieri creano diversi problemi al Manchester City, che crolla in quarta posizione, recuperando due posti con la vittoria sull'Arsenal di Wenger[6]. Al termine del campionato i Citizens si piazzano al terzo posto con 78 punti, alle spalle del Tottenham secondo (86 punti) e del Chelsea campione d'Inghilterra (93 punti), centrando così la qualificazione alla fase a gironi della UEFA Champions League 2017-2018.
In Champions League, il club di Guardiola, superato lo Steaua Bucarest ai preliminari di andata e ritorno[7], capita nello stesso girone di Borussia Mönchengladbach, Celtic e Barcelona (team dove Guardiola aveva giocato ed allenato). Pur non rendendosi protagonista di un'ottima fase a gironi (si segnalano le vittorie casalinghe su Borussia e Barcelona, ma anche una disfatta esterna al Camp Nou e pareggi rocamboleschi), riesce a classificarsi seconda nel girone, passando di diritto alla fase successiva del torneo, gli ottavi di finale, dove viene abbinata al Monaco[8], da cui è eliminato.
In FA Cup i Citizens esordiscono nel terzo turno, sconfiggendo in trasferta il West Ham Utd con un sonoro 0-5. Nel turno successivo il City elimina il Crystal Palace, vincendo 0-2 in casa loro. Nel quinto turno gli Sky Blues pareggiano a sorpresa contro l'Huddersfield (0-0 in trasferta) per poi aggiudicarsi il passaggio ai quarti di finale imponendosi nettamente nel replay della gara (5-1 in casa). Nei quarti la squadra di Guardiola ha la meglio sul Middlesbrough, battendoli 0-2 fuori casa. In semifinale i Citizens vengono sconfitti per 2-1 dopo i tempi supplementari dall'Arsenal (poi futuri vincitori della coppa), abbandonando così la competizione ad un passo dalla finale.
Fonte: Premier League – Classifiche, su sport.sky.it, sport.sky.it (archiviato dall'url originale il 5 gennaio 2016). Legenda: Luogo: C = Casa; T = Trasferta. Risultato: V = Vittoria; N = Pareggio; P = Sconfitta.