CDH5 — Вікіпедія

CDH5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KOH
Ідентифікатори
Символи	CDH5, 7B4, CD144, VE-cadherin, cadherin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 601120 MGI: 105057 HomoloGene: 1359 GeneCards: CDH5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • beta-catenin binding; • transmembrane transporter binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein phosphatase binding; • signaling receptor binding; • cytoskeletal protein binding; • protein homodimerization activity; • cadherin binding; • vascular endothelial growth factor receptor 2 binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • cell-cell junction; • bicellular tight junction; • Адгезивні контакти; • cell surface; • міжклітинні контакти; • external side of plasma membrane; • cell periphery; • клітинна мембрана; • catenin complex;
Біологічний процес	• positive regulation of establishment of endothelial barrier; • адгезія клітин; • cell-cell junction assembly; • adherens junction organization; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • regulation of establishment of cell polarity; • negative regulation of cell population proliferation; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • blood vessel maturation; • cell-cell adhesion; • negative regulation of inflammatory response; • positive regulation of angiogenesis; • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • cell-cell adhesion mediated by cadherin; • GO:0000767 cell morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1003
	12562
	ENSG00000179776
	ENSMUSG00000031871
	P33151
	P55284
	NM_001114117; NM_001795
	NM_009868
	NP_001786
	NP_033998
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDH5 (англ. Cadherin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784 амінокислот, а молекулярна маса — 87 528^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQRLMMLLAT	SGACLGLLAV	AAVAAAGANP	AQRDTHSLLP	THRRQKRDWI
WNQMHIDEEK	NTSLPHHVGK	IKSSVSRKNA	KYLLKGEYVG	KVFRVDAETG
DVFAIERLDR	ENISEYHLTA	VIVDKDTGEN	LETPSSFTIK	VHDVNDNWPV
FTHRLFNASV	PESSAVGTSV	ISVTAVDADD	PTVGDHASVM	YQILKGKEYF
AIDNSGRIIT	ITKSLDREKQ	ARYEIVVEAR	DAQGLRGDSG	TATVLVTLQD
INDNFPFFTQ	TKYTFVVPED	TRVGTSVGSL	FVEDPDEPQN	RMTKYSILRG
DYQDAFTIET	NPAHNEGIIK	PMKPLDYEYI	QQYSFIVEAT	DPTIDLRYMS
PPAGNRAQVI	INITDVDEPP	IFQQPFYHFQ	LKENQKKPLI	GTVLAMDPDA
ARHSIGYSIR	RTSDKGQFFR	VTKKGDIYNE	KELDREVYPW	YNLTVEAKEL
DSTGTPTGKE	SIVQVHIEVL	DENDNAPEFA	KPYQPKVCEN	AVHGQLVLQI
SAIDKDITPR	NVKFKFILNT	ENNFTLTDNH	DNTANITVKY	GQFDREHTKV
HFLPVVISDN	GMPSRTGTST	LTVAVCKCNE	QGEFTFCEDM	AAQVGVSIQA
VVAILLCILT	ITVITLLIFL	RRRLRKQARA	HGKSVPEIHE	QLVTYDEEGG
GEMDTTSYDV	SVLNSVRRGG	AKPPRPALDA	RPSLYAQVQK	PPRHAPGAHG
GPGEMAAMIE	VKKDEADHDG	DGPPYDTLHI	YGYEGSESIA	ESLSSLGTDS
SDSDVDYDFL	NDWGPRFKML	AELYGSDPRE	ELLY

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ali J., Liao F., Martens E., Muller W.A. (1997). Vascular endothelial cadherin (VE-cadherin): cloning and role in endothelial cell-cell adhesion. Microcirculation. 4: 267—277. PMID 9219219
Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1764 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P33151 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1764 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P33151 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350