TPCN1 — Вікіпедія

TPCN1
Ідентифікатори
Символи	TPCN1, TPC1, two pore segment channel 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609666 MGI: 2182472 HomoloGene: 9905 GeneCards: TPCN1
Реагує на сполуку
	phosphatidyl (3,5) inositol biphosphate, верапаміл
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium channel activity; • voltage-gated ion channel activity; • ion channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • NAADP-sensitive calcium-release channel activity; • voltage-gated calcium channel activity; • calcium activated cation channel activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • ендосома; • мембрана; • клітинна мембрана; • lysosomal membrane; • лізосома; • endosome membrane; • CatSper complex;
Біологічний процес	• membrane depolarization during action potential; • positive regulation of autophagy; • regulation of ion transmembrane transport; • ion transport; • ion transmembrane transport; • calcium ion transmembrane transport; • calcium ion transport; • трансмембранний транспорт; • release of sequestered calcium ion into cytosol; • flagellated sperm motility;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	53373
	252972
	ENSG00000186815
	ENSMUSG00000032741
	Q9ULQ1
	Q9EQJ0
	NM_001143819; NM_001301214; NM_017901; NM_001351346; NM_001351347
	NM_145853
	NP_001137291; NP_001288143; NP_060371; NP_001338275; NP_001338276
	NP_665852
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TPCN1 (англ. Two pore segment channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 816 амінокислот, а молекулярна маса — 94 147^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVSLDDDVP	LILTLDEGGS	APLAPSNGLG	QEELPSKNGG	SYAIHDSQAP
SLSSGGESSP	SSPAHNWEMN	YQEAAIYLQE	GENNDKFFTH	PKDAKALAAY
LFAHNHLFYL	MELATALLLL	LLSLCEAPAV	PALRLGIYVH	ATLELFALMV
VVFELCMKLR	WLGLHTFIRH	KRTMVKTSVL	VVQFVEAIVV	LVRQMSHVRV
TRALRCIFLV	DCRYCGGVRR	NLRQIFQSLP	PFMDILLLLL	FFMIIFAILG
FYLFSPNPSD	PYFSTLENSI	VSLFVLLTTA	NFPDVMMPSY	SRNPWSCVFF
IVYLSIELYF	IMNLLLAVVF	DTFNDIEKRK	FKSLLLHKRT	AIQHAYRLLI
SQRRPAGISY	RQFEGLMRFY	KPRMSARERY	LTFKALNQNN	TPLLSLKDFY
DIYEVAALKW	KAKKNREHWF	DELPRTALLI	FKGINILVKS	KAFQYFMYLV
VAVNGVWILV	ETFMLKGGNF	FSKHVPWSYL	VFLTIYGVEL	FLKVAGLGPV
EYLSSGWNLF	DFSVTVFAFL	GLLALALNME	PFYFIVVLRP	LQLLRLFKLK
ERYRNVLDTM	FELLPRMASL	GLTLLIFYYS	FAIVGMEFFC	GIVFPNCCNT
STVADAYRWR	NHTVGNRTVV	EEGYYYLNNF	DNILNSFVTL	FELTVVNNWY
IIMEGVTSQT	SHWSRLYFMT	FYIVTMVVMT	IIVAFILEAF	VFRMNYSRKN
QDSEVDGGIT	LEKEISKEEL	VAVLELYREA	RGASSDVTRL	LETLSQMERY
QQHSMVFLGR	RSRTKSDLSL	KMYQEEIQEW	YEEHAREQEQ	QRQLSSSAAP
AAQQPPGSRQ	RSQTVT

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504