TRPC4 — Вікіпедія

TRPC4
Ідентифікатори
Символи	TRPC4, HTRP-4, HTRP4, TRP4, transient receptor potential cation channel subfamily C member 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603651 MGI: 109525 HomoloGene: 22955 GeneCards: TRPC4
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Реагує на сполуку
	2-aminoethoxydiphenylborate
Онтологія гена
Молекулярна функція	• beta-catenin binding; • store-operated calcium channel activity; • cadherin binding; • inositol 1,4,5 trisphosphate binding; • ion channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • calcium channel activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • Кальцієві канали; • мембрана; • cell-cell junction; • cortical cytoskeleton; • клітинна мембрана; • cell surface; • basolateral plasma membrane; • caveola; • membrane raft; • integral component of plasma membrane; • GO:0009327 protein-containing complex; • cation channel complex;
Біологічний процес	• regulation of cytosolic calcium ion concentration; • calcium ion import; • oligodendrocyte differentiation; • ion transport; • calcium ion transmembrane transport; • manganese ion transport; • gamma-aminobutyric acid secretion; • calcium ion transport; • трансмембранний транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7223
	22066
	ENSG00000133107
	ENSMUSG00000027748
	Q9UBN4
	Q9QUQ5
NM_001135955; NM_001135956; NM_001135957; NM_001135958; NM_003306;
	NM_016179; NM_001354799; NM_001354806; NM_001372055
	NM_001253682; NM_001253683; NM_016984
NP_001129427; NP_001129428; NP_001129429; NP_001129430; NP_003297;
	NP_057263; NP_001341728; NP_001341735; NP_001358984
	NP_001240611; NP_001240612; NP_058680
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRPC4 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 977 амінокислот, а молекулярна маса — 112 101^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQFYYKRNV	NAPYRDRIPL	RIVRAESELS	PSEKAYLNAV	EKGDYASVKK
SLEEAEIYFK	ININCIDPLG	RTALLIAIEN	ENLELIELLL	SFNVYVGDAL
LHAIRKEVVG	AVELLLNHKK	PSGEKQVPPI	LLDKQFSEFT	PDITPIILAA
HTNNYEIIKL	LVQKGVSVPR	PHEVRCNCVE	CVSSSDVDSL	RHSRSRLNIY
KALASPSLIA	LSSEDPFLTA	FQLSWELQEL	SKVENEFKSE	YEELSRQCKQ
FAKDLLDQTR	SSRELEIILN	YRDDNSLIEE	QSGNDLARLK	LAIKYRQKEF
VAQPNCQQLL	ASRWYDEFPG	WRRRHWAVKM	VTCFIIGLLF	PVFSVCYLIA
PKSPLGLFIR	KPFIKFICHT	ASYLTFLFLL	LLASQHIDRS	DLNRQGPPPT
IVEWMILPWV	LGFIWGEIKQ	MWDGGLQDYI	HDWWNLMDFV	MNSLYLATIS
LKIVAFVKYS	ALNPRESWDM	WHPTLVAEAL	FAIANIFSSL	RLISLFTANS
HLGPLQISLG	RMLLDILKFL	FIYCLVLLAF	ANGLNQLYFY	YEETKGLTCK
GIRCEKQNNA	FSTLFETLQS	LFWSIFGLIN	LYVTNVKAQH	EFTEFVGATM
FGTYNVISLV	VLLNMLIAMM	NNSYQLIADH	ADIEWKFART	KLWMSYFEEG
GTLPTPFNVI	PSPKSLWYLI	KWIWTHLCKK	KMRRKPESFG	TIGRRAADNL
RRHHQYQEVM	RNLVKRYVAA	MIRDAKTEEG	LTEENFKELK	QDISSFRFEV
LGLLRGSKLS	TIQSANASKE	SSNSADSDEK	SDSEGNSKDK	KKNFSLFDLT
TLIHPRSAAI	ASERHNISNG	SALVVQEPPR	EKQRKVNFVT	DIKNFGLFHR
RSKQNAAEQN	ANQIFSVSEE	VARQQAAGPL	ERNIQLESRG	LASRGDLSIP
GLSEQCVLVD	HRERNTDTLG	LQVGKRVCPF	KSEKVVVEDT	VPIIPKEKHA
KEEDSSIDYD	LNLPDTVTHE	DYVTTRL

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Mery L., Magnino F., Schmidt K., Krause K.-H., Dufour J.-F. (2001). Alternative splice variants of hTrp4 differentially interact with the C-terminal portion of the inositol 1,4,5-trisphosphate receptors. FEBS Lett. 487: 377—383. PMID 11163362 DOI:10.1016/S0014-5793(00)02362-0
Schaefer M., Plant T.D., Stresow N., Albrecht N., Schultz G. (2002). Functional differences between TRPC4 splice variants. J. Biol. Chem. 277: 3752—3759. PMID 11713258 DOI:10.1074/jbc.M109850200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hofmann T., Schaefer M., Schultz G., Gudermann T. (2002). Subunit composition of mammalian transient receptor potential channels in living cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7461—7466. PMID 12032305 DOI:10.1073/pnas.102596199
Odell A.F., Scott J.L., Van Helden D.F. (2005). Epidermal growth factor induces tyrosine phosphorylation, membrane insertion, and activation of transient receptor potential channel 4. J. Biol. Chem. 280: 37974—37987. PMID 16144838 DOI:10.1074/jbc.M503646200
Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009