BATF Ідентифікатори Символи BATF , B-ATF, BATF1, SFA-2, SFA2, basic leucine zipper ATF-like transcription factor Зовнішні ІД OMIM : 612476 MGI: 1859147 HomoloGene: 4666 GeneCards: BATF Пов'язані генетичні захворювання розсіяний склероз [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • T-helper 2 cell differentiation • GO:0032617 cytokine production • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • myeloid dendritic cell differentiation • lymphoid progenitor cell differentiation • T-helper 17 cell lineage commitment • cellular response to DNA damage stimulus • hematopoietic stem cell differentiation • Перемикання класу імуноглобулінів • T-helper 17 cell differentiation • defense response to protozoan • cytokine-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 14: 75.52 – 75.55 Mb Хр. 12: 85.73 – 85.76 Mb PubMed search [ 2] [ 3] Вікідані
BATF (англ. Basic leucine zipper ATF-like transcription factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 125 амінокислот , а молекулярна маса — 14 120[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MPHSSDSSDS SFSRSPPPGK QDSSDDVRRV QRREKNRIAA QKSRQRQTQK ADTLHLESED LEKQNAALRK EIKQLTEELK YFTSVLNSHE PLCSVLAAST PSPPEVVYSA HAFHQPHVSS PRFQP
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація клітин . Білок має сайт для зв'язування з ДНК . Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504 Wang X., Johansen L.M., Tae H.-J., Taparowsky E.J. (1996). IFP 35 forms complexes with B-ATF, a member of the AP1 family of transcription factors. Biochem. Biophys. Res. Commun . 229 : 316—322. PMID 8954125 DOI :10.1006/bbrc.1996.1799 Echlin D.R., Tae H.-J., Mitin N., Taparowsky E.J. (2000). B-ATF functions as a negative regulator of AP-1 mediated transcription and blocks cellular transformation by Ras and Fos. Oncogene . 19 : 1752—1763. PMID 10777209 DOI :10.1038/sj.onc.1203491
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші