MNX1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | MNX1, HB9, HLXB9, HOXHB9, SCRA1, motor neuron and pancreas homeobox 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 142994 MGI: 109160 HomoloGene: 21137 GeneCards: MNX1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Currarino syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • humoral immune response • neuron projection morphogenesis • spinal cord motor neuron cell fate specification • transcription, DNA-templated • anatomical structure morphogenesis • endocrine pancreas development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b1/PBB_GE_HLXB9_214614_at_fs.png/250px-PBB_GE_HLXB9_214614_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 156.99 – 157.01 Mb | Хр. 5: 29.68 – 29.68 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
|
MNX1 (англ. Motor neuron and pancreas homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 401 амінокислот, а молекулярна маса — 40 569[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEKSKNFRID | | ALLAVDPPRA | | ASAQSAPLAL | | VTSLAAAASG | | TGGGGGGGGA |
SGGTSGSCSP | | ASSEPPAAPA | | DRLRAESPSP | | PRLLAAHCAL | | LPKPGFLGAG |
GGGGGTGGGH | | GGPHHHAHPG | | AAAAAAAAAA | | AAAAGGLALG | | LHPGGAQGGA |
GLPAQAALYG | | HPVYGYSAAA | | AAAALAGQHP | | ALSYSYPQVQ | | GAHPAHPADP |
IKLGAGTFQL | | DQWLRASTAG | | MILPKMPDFN | | SQAQSNLLGK | | CRRPRTAFTS |
QQLLELEHQF | | KLNKYLSRPK | | RFEVATSLML | | TETQVKIWFQ | | NRRMKWKRSK |
KAKEQAAQEA | | EKQKGGGGGA | | GKGGAEEPGA | | EELLGPPAPG | | DKGSGRRLRD |
LRDSDPEEDE | | DEDDEDHFPY | | SNGASVHAAS | | SDCSSEDDSP | | PPRPSHQPAP |
Q |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
- Harrison K.A., Druey K.M., Deguchi Y., Tuscano J.M., Kehrl J.H. (1994). A novel human homeobox gene distantly related to proboscipedia is expressed in lymphoid and pancreatic tissues. J. Biol. Chem. 269: 19968—19975. PMID 7914194
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | |
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|