HNF4G |
---|
|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | HNF4G, NR2A2, NR2A3, Hepatocyte nuclear factor 4 gamma |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605966 MGI: 1353604 HomoloGene: 37886 GeneCards: HNF4G |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • steroid hormone receptor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • intracellular receptor signaling pathway • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • steroid hormone mediated signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 75.41 – 75.57 Mb | Хр. 3: 3.57 – 3.72 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
|
HNF4G (англ. Hepatocyte nuclear factor 4 gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 408 амінокислот, а молекулярна маса — 45 877[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNTTDNGVNC | | LCAICGDRAT | | GKHYGASSCD | | GCKGFFRRSI | | RKSHVYSCRF |
SRQCVVDKDK | | RNQCRYCRLR | | KCFRAGMKKE | | AVQNERDRIS | | TRRSTFDGSN |
IPSINTLAQA | | EVRSRQISVS | | SPGSSTDINV | | KKIASIGDVC | | ESMKQQLLVL |
VEWAKYIPAF | | CELPLDDQVA | | LLRAHAGEHL | | LLGATKRSMM | | YKDILLLGNN |
YVIHRNSCEV | | EISRVANRVL | | DELVRPFQEI | | QIDDNEYACL | | KAIVFFDPDA |
KGLSDPVKIK | | NMRFQVQIGL | | EDYINDRQYD | | SRGRFGELLL | | LLPTLQSITW |
QMIEQIQFVK | | LFGMVKIDNL | | LQEMLLGGAS | | NDGSHLHHPM | | HPHLSQDPLT |
GQTILLGPMS | | TLVHADQIST | | PETPLPSPPQ | | GSGQEQYKIA | | ANQASVISHQ |
HLSKQKQL |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|