HOXB4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | HOXB4, HOX-2.6, HOX2, HOX2F, homeobox B4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 142965 MGI: 96185 HomoloGene: 32095 GeneCards: HOXB4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • центросома |
---|
Біологічний процес | • embryonic skeletal system morphogenesis • multicellular organism development • definitive hemopoiesis • somatic stem cell division • skeletal system morphogenesis • проліферація • positive regulation of stem cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • spleen development • hematopoietic stem cell differentiation • morphogenesis of an epithelial sheet • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • bone marrow development • кровотворення • skeletal system development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 48.58 – 48.58 Mb | Хр. 11: 96.21 – 96.21 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
|
HOXB4 (англ. Homeobox B4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 251 амінокислот, а молекулярна маса — 27 604[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAMSSFLINS | | NYVDPKFPPC | | EEYSQSDYLP | | SDHSPGYYAG | | GQRRESSFQP |
EAGFGRRAAC | | TVQRYAACRD | | PGPPPPPPPP | | PPPPPPPGLS | | PRAPAPPPAG |
ALLPEPGQRC | | EAVSSSPPPP | | PCAQNPLHPS | | PSHSACKEPV | | VYPWMRKVHV |
STVNPNYAGG | | EPKRSRTAYT | | RQQVLELEKE | | FHYNRYLTRR | | RRVEIAHALC |
LSERQIKIWF | | QNRRMKWKKD | | HKLPNTKIRS | | GGAAGSAGGP | | PGRPNGGPRA |
L |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|