SIM2 — Вікіпедія

SIM2
Ідентифікатори
Символи	SIM2, HMC13F06, HMC29C01, SIM, bHLHe15, single-minded family bHLH transcription factor 2, SIM bHLH transcription factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600892 MGI: 98307 HomoloGene: 3716 GeneCards: SIM2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • protein heterodimerization activity; • protein dimerization activity; • DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • ядерні тільця; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • диференціація клітин; • embryonic pattern specification; • transcription, DNA-templated; • lung development; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • нейробіологія розвитку;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6493
	20465
	ENSG00000159263
	ENSMUSG00000062713
	Q14190
	н/д
	NM_005069; NM_009586
	NM_011377
	NP_005060; NP_033664
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SIM2 (англ. Single-minded family bHLH transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 667 амінокислот, а молекулярна маса — 73 219^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKEKSKNAAK	TRREKENGEF	YELAKLLPLP	SAITSQLDKA	SIIRLTTSYL
KMRAVFPEGL	GDAWGQPSRA	GPLDGVAKEL	GSHLLQTLDG	FVFVVASDGK
IMYISETASV	HLGLSQVELT	GNSIYEYIHP	SDHDEMTAVL	TAHQPLHHHL
LQEYEIERSF	FLRMKCVLAK	RNAGLTCSGY	KVIHCSGYLK	IRQYMLDMSL
YDSCYQIVGL	VAVGQSLPPS	AITEIKLYSN	MFMFRASLDL	KLIFLDSRVT
EVTGYEPQDL	IEKTLYHHVH	GCDVFHLRYA	HHLLLVKGQV	TTKYYRLLSK
RGGWVWVQSY	ATVVHNSRSS	RPHCIVSVNY	VLTEIEYKEL	QLSLEQVSTA
KSQDSWRTAL	STSQETRKLV	KPKNTKMKTK	LRTNPYPPQQ	YSSFQMDKLE
CGQLGNWRAS	PPASAAAPPE	LQPHSESSDL	LYTPSYSLPF	SYHYGHFPLD
SHVFSSKKPM	LPAKFGQPQG	SPCEVARFFL	STLPASGECQ	WHYANPLVPS
SSSPAKNPPE	PPANTARHSL	VPSYEAPAAA	VRRFGEDTAP	PSFPSCGHYR
EEPALGPAKA	ARQAARDGAR	LALARAAPEC	CAPPTPEAPG	APAQLPFVLL
NYHRVLARRG	PLGGAAPAAS	GLACAPGGPE	AATGALRLRH	PSPAATSPPG
APLPHYLGAS	VIITNGR

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Osoegawa K., Okano S., Kato Y., Nishimura Y., Soeda E. (1996). A 19-kb CpG island associated with single-minded gene 2 in Down syndrome chromosomal region. DNA Res. 3: 175—179. PMID 8905236 DOI:10.1093/dnares/3.3.175
Yamaki A., Kudoh J., Shimizu N., Shimizu Y. (2004). A novel nuclear localization signal in the human single-minded proteins SIM1 and SIM2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 313: 482—488. PMID 14697214 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.11.168

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10883 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14190 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10883 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q14190 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]