HIVEP3 — Вікіпедія

HIVEP3
Ідентифікатори
Символи	HIVEP3, Hivep3, 2900056N03Rik, A130075N07, AI848000, E030045D18Rik, KBP-1, KBP1, Rc, Schnurri-3, Shn3, Zas3, ZNF40C, human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3, Kappa Recognition Component (Krc), KRC, HIVEP zinc finger 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606649 MGI: 106589 HomoloGene: 7803 GeneCards: HIVEP3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • зв'язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • skeletal muscle cell differentiation; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	59269
	16656
	ENSG00000127124
	ENSMUSG00000028634
	Q5T1R4
	A2A884
	NM_001127714; NM_024503
	NM_010657
	NP_001121186; NP_078779
	NP_034787
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HIVEP3 (англ. Human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 406 амінокислот, а молекулярна маса — 259 465^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDPEQSVKGT	KKAEGSPRKR	LTKGEAIQTS	VSSSVPYPGS	GTAATQESPA
QELLAPQPFP	GPSSVLREGS	QEKTGQQQKP	PKRPPIEASV	HISQLPQHPL
TPAFMSPGKP	EHLLEGSTWQ	LVDPMRPGPS	GSFVAPGLHP	QSQLLPSHAS
IIPPEDLPGV	PKVFVPRPSQ	VSLKPTEEAH	KKERKPQKPG	KYICQYCSRP
CAKPSVLQKH	IRSHTGERPY	PCGPCGFSFK	TKSNLYKHRK	SHAHRIKAGL
ASGMGGEMYP	HGLEMERIPG	EEFEEPTEGE	STDSEEETSA	TSGHPAELSP
RPKQPLLSSG	LYSSGSHSSS	HERCSLSQSS	TAQSLEDPPP	FVEPSSEHPL
SHKPEDTHTI	KQKLALRLSE	RKKVIDEQAF	LSPGSKGSTE	SGYFSRSESA
EQQVSPPNTN	AKSYAEIIFG	KCGRIGQRTA	MLTATSTQPL	LPLSTEDKPS
LVPLSVPRTQ	VIEHITKLIT	INEAVVDTSE	IDSVKPRRSS	LSRRSSMESP
KSSLYREPLS	SHSEKTKPEQ	SLLSLQHPPS	TAPPVPLLRS	HSMPSAACTI
STPHHPFRGS	YSFDDHITDS	EALSHSSHVF	TSHPRMLKRQ	PAIELPLGGE
YSSEEPGPSS	KDTASKPSDE	VEPKESELTK	KTKKGLKTKG	VIYECNICGA
RYKKRDNYEA	HKKYYCSELQ	IAKPISAGTH	TSPEAEKSQI	EHEPWSQMMH
YKLGTTLELT	PLRKRRKEKS	LGDEEEPPAF	ESTKSQFGSP	GPSDAARNLP
LESTKSPAEP	SKSVPSLEGP	TGFQPRTPKP	GSGSESGKER	RTTSKEISVI
QHTSSFEKSD	SLEQPSGLEG	EDKPLAQFPS	PPPAPHGRSA	HSLQPKLVRQ
PNIQVPEILV	TEEPDRPDTE	PEPPPKEPEK	TEEFQWPQRS	QTLAQLPAEK
LPPKKKRLRL	AEMAQSSGES	SFESSVPLSR	SPSQESNVSL	SGSSRSASFE
RDDHGKAEAP	SPSSDMRPKP	LGTHMLTVPS	HHPHAREMRR	SASEQSPNVS
HSAHMTETRS	KSFDYGSLSL	TGPSAPAPVA	PPARVAPPER	RKCFLVRQAS
LSRPPESELE	VAPKGRQESE	EPQPSSSKPS	AKSSLSQISS	AATSHGGPPG
GKGPGQDRPP	LGPTVPYTEA	LQVFHHPVAQ	TPLHEKPYLP	PPVSLFSFQH
LVQHEPGQSP	EFFSTQAMSS	LLSSPYSMPP	LPPSLFQAPP	LPLQPTVLHP
GQLHLPQLMP	HPANIPFRQP	PSFLPMPYPT	SSALSSGFFL	PLQSQFALQL
PGDVESHLPQ	IKTSLAPLAT	GSAGLSPSTE	YSSDIRLPPV	APPASSSAPT
SAPPLALPAC	PDTMVSLVVP	VRVQTNMPSY	GSAMYTTLSQ	ILVTQSQGSS
ATVALPKFEE	PPSKGTTVCG	ADVHEVGPGP	SGLSEEQSRA	FPTPYLRVPV
TLPERKGTSL	SSESILSLEG	SSSTAGGSKR	VLSPAGSLEL	TMETQQQKRV
KEEEASKADE	KLELVKPCSV	VLTSTEDGKR	PEKSHLGNQG	QGRRELEMLS
SLSSDPSDTK	EIPPLPHPAL	SHGTAPGSEA	LKEYPQPSGK	PHRRGLTPLS
VKKEDSKEQP	DLPSLAPPSS	LPLSETSSRP	AKSQEGTDSK	KVLQFPSLHT
TTNVSWCYLN	YIKPNHIQHA	DRRSSVYAGW	CISLYNPNLP	GVSTKAALSL
LRSKQKVSKE	TYTMATAPHP	EAGRLVPSSS	RKPRMTEVHL	PSLVSPEGQK
DLARVEKEEE	RRGEPEEDAP	ASQRGEPARI	KIFEGGYKSN	EEYVYVRGRG
RGKYVCEECG	IRCKKPSMLK	KHIRTHTDVR	PYVCKHCHFA	FKTKGNLTKH
MKSKAHSKKC	QETGVLEELE	AEEGTSDDLF	QDSEGREGSE	AVEEHQFSDL
EDSDSDSDLD	EDEDEDEEES	QDELSRPSSE	APPPGPPHAL	RADSSPILGP
QPPDAPASGT	EATRGSSVSE	AERLTASSCS	MSSQSMPGLP	WLGPAPLGSV
EKDTGSALSY	KPVSPRRPWS	PSKEAGSRPP	LARKHSLTKN	DSSPQRCSPA
REPQASAPSP	PGLHVDPGRG	MGALPCGSPR	LQLSPLTLCP	LGRELAPRAH
VLSKLEGTTD	PGLPRYSPTR	RWSPGQAESP	PRSAPPGKWA	LAGPGSPSAG
EHGPGLGLDP	RVLFPPAPLP	HKLLSRSPET	CASPWQKAES	RSPSCSPGPA
HPLSSRPFSA	LHDFHGHILA	RTEENIFSHL	PLHSQHLTRA	PCPLIPIGGI
QMVQARPGAH	PTLLPGPTAA	WVSGFSGGGS	DLTGAREAQE	RGRWSPTESS
SASVSPVAKV	SKFTLSSELE	GGDYPKERER	TGGGPGRPPD	WTPHGTGAPA
EPTPTHSPCT	PPDTLPRPPQ	GRRAAQSWSP	RLESPRAPTN	PEPSATPPLD
RSSSVGCLAE	ASARFPARTR	NLSGEPRTRQ	DSPKPSGSGE	PRAHPHQPED
RVPPNA

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Hicar M.D., Liu Y., Allen C.E., Wu L.-C. (2001). Structure of the human zinc finger protein HIVEP3: molecular cloning, expression, exon-intron structure, and comparison with paralogous genes HIVEP1 and HIVEP2. Genomics. 71: 89—100. PMID 11161801 DOI:10.1006/geno.2000.6425
Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13561 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q5T1R4 (англ.) . Архів оригіналу за 3 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13561 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q5T1R4 (англ.) . Архів оригіналу за 3 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]