ZNF10 Ідентифікатори Символи ZNF10 , KOX1, zinc finger protein 10 Зовнішні ІД OMIM : 194538 HomoloGene: 130674 GeneCards: ZNF10 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 12: 133.13 – 133.16 Mb н/д PubMed search [ 1] н/д Вікідані
ZNF10 (англ. Zinc finger protein 10 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 573 амінокислот , а молекулярна маса — 66 455[ 3] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MDAKSLTAWS RTLVTFKDVF VDFTREEWKL LDTAQQIVYR NVMLENYKNL VSLGYQLTKP DVILRLEKGE EPWLVEREIH QETHPDSETA FEIKSSVSSR SIFKDKQSCD IKMEGMARND LWYLSLEEVW KCRDQLDKYQ ENPERHLRQV AFTQKKVLTQ ERVSESGKYG GNCLLPAQLV LREYFHKRDS HTKSLKHDLV LNGHQDSCAS NSNECGQTFC QNIHLIQFAR THTGDKSYKC PDNDNSLTHG SSLGISKGIH REKPYECKEC GKFFSWRSNL TRHQLIHTGE KPYECKECGK SFSRSSHLIG HQKTHTGEEP YECKECGKSF SWFSHLVTHQ RTHTGDKLYT CNQCGKSFVH SSRLIRHQRT HTGEKPYECP ECGKSFRQST HLILHQRTHV RVRPYECNEC GKSYSQRSHL VVHHRIHTGL KPFECKDCGK CFSRSSHLYS HQRTHTGEKP YECHDCGKSF SQSSALIVHQ RIHTGEKPYE CCQCGKAFIR KNDLIKHQRI HVGEETYKCN QCGIIFSQNS PFIVHQIAHT GEQFLTCNQC GTALVNTSNL IGYQTNHIRE NAY
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК . Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Thiesen H.-J. (1990). Multiple genes encoding zinc finger domains are expressed in human T cells. New Biol . 2 : 363—374. PMID 2288909
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші