ZNF318 (англ. Zinc finger protein 318 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 279 амінокислот , а молекулярна маса — 251 112[5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MYRSSARSSV SSHRPKDDGG GGPRSGRSSG SSSGPARRSS PPPPPSGSSS RTPARRPRSP SGHRGRRASP SPPRGRRVSP SPPRARRGSP SPPRGRRLFP PGPAGFRGSS RGESRADYAR DGRGDHPGDS GSRRRSPGLC SDSLEKSLRI TVGNDHFCVS TPERRRLSDR LGSPVDNLED MDRDDLTDDS VFTRSSQCSR GLERYISQEE GPLSPFLGQL DEDYRTKETF LHRSDYSPHI SCHDELLRGT ERNREKLKGY SIRSEERSRE AKRPRYDDTV KINSMGGDHP SFTSGTRNYR QRRRSPSPRF LDPEFRELDL ARRKREEEEE RSRSLSQELV GVDGGGTGCS IPGLSGVLTA SEPGYSLHRP EEVSVMPKKS ILKKRIEVDI MEPSMQLESF SSSTSSSQDH PLYSGHPSLP LSGAIAAFAS EIENKGTMVE TALKEPQGNL YQWGPLPGIP KDNSPLREKF GSFLCHKDNL DLKAEGPERH TDFLLPHERA SQDGSGFSRI LSMLADSTST QEKRRRSFPD IEDEEKFLYG DEEEDLKAES VPKPLGSSES EVMRQKASSL PSSAPAVKLE SLEETNPEYA KIHDLLKTIG LDIGVAEISQ LAARTQERLH GKKPSLRSSA DRRSSVDRYF SADHCSSVDH RFSADRCSSV DHCFSADRRS SDPHRLESRE AHHSNTHSPE VSHPHPPSPV DPYLLTKNSP PFLKSDHPVG HISGPEVVGS GFQSSVAVRC MLPSAPSAPI RLPHTAALSQ FHMPRASQFA AARIPPNYQG PAIPPASFDA YRHYMAYAAS RWPMYPTSQP SNHPVPEPHR IMPITKQATR SRPNLRVIPT VTPDKPKQKE SLRGSIPAAQ VPVQVSIPSL IRYNPEKISD EKNRASQKQK VIEEREKLKN DREARQKKMY YLRTELERLH KQQGEMLRKK RREKDGHKDP LLVEVSRLQD NIMKDIAELR QEAEEAEKKQ SELDKVAQIL GINIFDKSQK SLSDSREPTE KPGKAEKSKS PEKVSSFSNS SSNKESKVNN EKFRTKSPKP AESPQSATKQ LDQPTAAYEY YDAGNHWCKD CNTICGTMFD FFTHMHNKKH TQTLDPYNRP WASKTQSEAK QDAIKRTDKI TVPAKGSEFL VPISGFYCQL CEEFLGDPIS GEQHVKGHQH NEKYKKYVDE NPLYEERRNL DRQAGLAVVL ETERRRQSEL KRKLSEKPKE EKKEKKAKAV KEVKEDDKVS EKLEDQLSEG RNSPEKAENK RNTGIKLQLK EEVKKESPTS SSFGKFSWKK PEKEEEKSSL VTPSISKEEI LESSKDKEDG KTEAGKAKPI KIKLSGKTVV AHTSPWMPVV TTSTQTKIRP NLPIPSTVLR KSCSATMSKP APLNTFLSIK SSGTTAKPLP VVKESSADLL LPPDIISKAF GGEEVILKGS PEEKVVLAEK SEPSHLPEQI LPPPPPPPPP PPPPPPVIPH PAAPSAAQAN AILAPVKSNP VVSQTLSPGF VGPNILNPVL PVAIMASAQP AAIPSDETAP GVSESDRDQT LFSVLVRPPP PLSSVFSEQA KKLEKRNSCL ATANAKDLYD IFYSSGGKGA PETKGAPETK LSGGPLANGE NSNLSRTKSS DTSSTSPLNS SASQEELHQD EGLVAAPIVS NSEKPIAKTL VALGKWSVVE HVGPKSTGST YGFLQPLTRL CQSRPYETIT PKTDTLAIWT SSSFQSDTSR DISPEKSELD LGEPGPPGVE PPPQLLDIQC KESQKLVEIH LRESVNQDKE SQELRKSEDC RESEIETNTE LKERVKELSE GIVDEGVSTS IGPHSIDDSN LNHGNRYMWE GEVKQPNLLM IDKEAEQSNK LMTGSETPSK VVIKLSPQAC SFTKAKLDSF LSEARSLLNP QDTPVKISAP ELLLHSPARS AMCLTGSPQE QGVSVVSEEG LENSAPESAS RTSRYRSLKL KRERSKDFQV KKIYELAVWD ENKKRPETWE SPEKPKTEAL ELQDVHPELT VTIESKALED FEATDLKVEE LTALGNLGDM PVDFCTTRVS PAHRSPTVLC QKVCEENSVS PIGCNSSDPA DFEPIPSFSG FPLDSPKTLV LDFETEGERN SPNPRSVRIP SPNILKTGLT ENVDRGLGGL EGTHQALDLL AGGMMPEEVK ESSQLDKQES LGLELKTINS AGLGPSPCLP DLVDFVTRTS GVQKDKLCSP LSEPGDPSKC SSLELGPLQL EISNASTTEV AILQVDDDSG DPLNLVKAPV SRSPPREQVI EDNMVPQGMP EQETTVGAIQ DHTESSVHN
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , мейоз , альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку . Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504 Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep . 10 : 1778—1791. PMID 25772364 DOI :10.1016/j.celrep.2015.02.033
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер (2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль (3.4) Фактори теплового шоку (3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR (4.2) STAT (4.3) p53 (4.4) MADS (4.6) TATA (4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні (0.6) Інші